72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0145 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0145  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 530 aa  1087    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1918  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 557 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 523 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 		 567 aa  97.1  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  28.87 
 
 		 505 aa  94.7  4e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 559 aa  91.3  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 541 aa  83.6  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 585 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 558 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 571 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  22.52 
 
 		 522 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 536 aa  73.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 557 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0663  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.15 
 
 		 556 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000120034  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  22.07 
 
 		 510 aa  70.1  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 		 510 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 544 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 509 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  22.4 
 
 		 492 aa  65.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2032  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 531 aa  65.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17890  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.64 
 
 		 527 aa  63.9  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  28.83 
 
 		 522 aa  64.3  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 		 533 aa  63.5  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 486 aa  63.5  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.2 
 
 		 503 aa  61.6  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 549 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2194  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 414 aa  55.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00903267  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  29.82 
 
 		 425 aa  54.3  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 		 443 aa  54.3  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2094  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 		 441 aa  53.5  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000152964 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  21.1 
 
 		 434 aa  52.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  21.2 
 
 		 537 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 435 aa  52  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  24.55 
 
 		 551 aa  52  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.182513 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02830  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.62 
 
 		 537 aa  51.2  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2733  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 533 aa  51.2  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000105202  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 422 aa  51.6  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.96 
 
 		 520 aa  51.2  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 423 aa  51.2  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2554  extracellular solute-binding protein family 1  20.45 
 
 		 548 aa  50.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00103966  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.25 
 
 		 425 aa  50.4  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  29.71 
 
 		 495 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  29.19 
 
 		 443 aa  48.5  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  22.33 
 
 		 553 aa  48.5  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  22.03 
 
 		 551 aa  48.5  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01630  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.93 
 
 		 557 aa  47.4  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1088  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 		 414 aa  47.4  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00683834  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 444 aa  47.4  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 433 aa  47  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  21.58 
 
 		 428 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 		 434 aa  46.6  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0310  extracellular solute-binding protein family 1  22.06 
 
 		 566 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  21.2 
 
 		 556 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.59 
 
 		 552 aa  45.8  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 425 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2458  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 588 aa  46.2  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 		 424 aa  46.2  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  20.07 
 
 		 424 aa  46.2  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0374  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 		 458 aa  45.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0240532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  22.85 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 434 aa  44.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 		 445 aa  44.7  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0697  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 		 514 aa  44.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000787338  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.24 
 
 		 419 aa  44.3  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 435 aa  43.5  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2029  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.27 
 
 		 526 aa  43.5  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 		 451 aa  43.5  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>