68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0341 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 537 aa  1103    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  38.89 
 
 		 522 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  34.62 
 
 		 509 aa  280  4e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  32.55 
 
 		 510 aa  264  4e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.51 
 
 		 503 aa  133  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 558 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 		 559 aa  100  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 544 aa  88.2  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 510 aa  85.1  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2733  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 533 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000105202  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 523 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  30.7 
 
 		 549 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  27.07 
 
 		 525 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  30.59 
 
 		 567 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 		 505 aa  78.2  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  29.91 
 
 		 571 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6724  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 		 563 aa  74.7  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 541 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  32.11 
 
 		 533 aa  69.7  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.76 
 
 		 552 aa  68.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 536 aa  68.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0409  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 561 aa  66.6  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.665828  normal  0.0938708 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 585 aa  65.1  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  30.43 
 
 		 486 aa  63.5  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3388  extracellular solute-binding protein family 1  22.27 
 
 		 547 aa  63.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  29.14 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  29.14 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1319  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 548 aa  61.6  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.981957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  20.82 
 
 		 522 aa  60.5  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0482  extracellular solute-binding protein  32.2 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00268905  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  28.95 
 
 		 492 aa  59.3  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  46.88 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1609  ABC-type sugar transport system periplasmic component  23.64 
 
 		 557 aa  58.9  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.051709  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0130  extracellular solute-binding protein family 1  23.41 
 
 		 561 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  23.69 
 
 		 553 aa  57.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  56.82 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10080  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.17 
 
 		 544 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 557 aa  56.6  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1293  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.8 
 
 		 564 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.719816 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3570  hypothetical protein  24.38 
 
 		 566 aa  56.2  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2032  extracellular solute-binding protein family 1  28.07 
 
 		 531 aa  54.3  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1708  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 518 aa  54.3  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 552 aa  54.3  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3336  extracellular solute-binding protein family 1  22.1 
 
 		 537 aa  53.9  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.12 
 
 		 425 aa  53.9  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2094  extracellular solute-binding protein family 1  40 
 
 		 441 aa  53.9  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000152964 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.57 
 
 		 520 aa  53.9  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05750  hypothetical protein  21.96 
 
 		 568 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  23.7 
 
 		 551 aa  53.5  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  22.75 
 
 		 556 aa  52.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5565  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 552 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379464  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0145  extracellular solute-binding protein family 1  19.95 
 
 		 530 aa  50.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02830  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 		 537 aa  50.1  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1437  extracellular solute-binding protein family 1  21.51 
 
 		 544 aa  50.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 454 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4040  hypothetical protein  21.77 
 
 		 567 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  25 
 
 		 551 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.182513 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0310  extracellular solute-binding protein family 1  21.9 
 
 		 566 aa  49.3  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 542 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 449 aa  47.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03340  extracellular solute-binding protein family 1  30.46 
 
 		 439 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 422 aa  45.4  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1077  extracellular solute-binding protein  21.89 
 
 		 477 aa  45.4  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182725  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.38 
 
 		 419 aa  44.3  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0270  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 419 aa  43.5  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.562219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>