35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4040 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05750  hypothetical protein  67.78 
 
 		 568 aa  788    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4040  hypothetical protein  100 
 
 		 567 aa  1148    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6724  extracellular solute-binding protein family 1  28.28 
 
 		 563 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10080  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.5 
 
 		 544 aa  163  8.000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04170  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.12 
 
 		 547 aa  160  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.401805  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1609  ABC-type sugar transport system periplasmic component  28.4 
 
 		 557 aa  156  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.051709  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3388  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 		 547 aa  154  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1579  putative lipoprotein precursor LplA  27.94 
 
 		 552 aa  145  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1319  extracellular solute-binding protein family 1  28.47 
 
 		 548 aa  145  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.981957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5565  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 		 552 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379464  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4938  ABC-type sugar transport system periplasmic component  27.19 
 
 		 558 aa  138  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000971011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4682  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 565 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00316141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2170  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 532 aa  127  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76717  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1437  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 		 544 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3336  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 		 537 aa  123  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0409  extracellular solute-binding protein family 1  26.64 
 
 		 561 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.665828  normal  0.0938708 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.35 
 
 		 552 aa  120  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1293  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.28 
 
 		 564 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.719816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5755  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.78 
 
 		 544 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 509 aa  99.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1769  hypothetical protein  23.35 
 
 		 560 aa  99.4  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0593052  normal  0.250375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0130  extracellular solute-binding protein family 1  25.04 
 
 		 561 aa  97.8  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  22.63 
 
 		 510 aa  83.6  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  25.35 
 
 		 525 aa  63.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.35 
 
 		 503 aa  61.6  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 567 aa  53.9  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  20.51 
 
 		 522 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  24.63 
 
 		 553 aa  50.4  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  21.77 
 
 		 537 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2335  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 		 482 aa  48.9  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  23.75 
 
 		 551 aa  48.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.67 
 
 		 435 aa  47.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1285  hypothetical protein  21.06 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0350392  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1104  hypothetical protein  21.06 
 
 		 467 aa  45.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.229225  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0862  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 		 568 aa  45.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>