33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5565 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5565  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 552 aa  1133    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379464  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1609  ABC-type sugar transport system periplasmic component  59.45 
 
 		 557 aa  701    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.051709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1293  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  47.07 
 
 		 564 aa  445  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.719816 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0409  extracellular solute-binding protein family 1  40.67 
 
 		 561 aa  405  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.665828  normal  0.0938708 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  41.67 
 
 		 552 aa  383  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10080  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  38.05 
 
 		 544 aa  382  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3336  extracellular solute-binding protein family 1  37.61 
 
 		 537 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2170  extracellular solute-binding protein family 1  39.14 
 
 		 532 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76717  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1319  extracellular solute-binding protein family 1  38.37 
 
 		 548 aa  344  2e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.981957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1769  hypothetical protein  32.49 
 
 		 560 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0593052  normal  0.250375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4682  extracellular solute-binding protein family 1  30.85 
 
 		 565 aa  260  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00316141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4938  ABC-type sugar transport system periplasmic component  31 
 
 		 558 aa  248  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000971011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6724  extracellular solute-binding protein family 1  29.8 
 
 		 563 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1437  extracellular solute-binding protein family 1  29.98 
 
 		 544 aa  187  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3388  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 547 aa  178  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5755  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.46 
 
 		 544 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05750  hypothetical protein  29.58 
 
 		 568 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1579  putative lipoprotein precursor LplA  27.34 
 
 		 552 aa  159  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0130  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 561 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04170  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.05 
 
 		 547 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.401805  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4040  hypothetical protein  27.11 
 
 		 567 aa  141  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 509 aa  71.6  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 510 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  19.96 
 
 		 523 aa  60.5  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.82 
 
 		 503 aa  53.9  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 537 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 571 aa  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  22.42 
 
 		 510 aa  48.5  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 443 aa  48.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  22.44 
 
 		 522 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  20.48 
 
 		 567 aa  45.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  32.1 
 
 		 439 aa  43.5  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>