31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4938 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4938  ABC-type sugar transport system periplasmic component  100 
 
 		 558 aa  1130    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000971011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4682  extracellular solute-binding protein family 1  45.44 
 
 		 565 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00316141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1609  ABC-type sugar transport system periplasmic component  35.96 
 
 		 557 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.051709  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10080  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  34.55 
 
 		 544 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3336  extracellular solute-binding protein family 1  32.01 
 
 		 537 aa  271  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0409  extracellular solute-binding protein family 1  32.07 
 
 		 561 aa  267  4e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.665828  normal  0.0938708 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.46 
 
 		 552 aa  266  5.999999999999999e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1319  extracellular solute-binding protein family 1  32.91 
 
 		 548 aa  256  9e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.981957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1769  hypothetical protein  31.91 
 
 		 560 aa  245  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0593052  normal  0.250375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2170  extracellular solute-binding protein family 1  30.49 
 
 		 532 aa  241  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76717  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1293  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  32.75 
 
 		 564 aa  236  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.719816 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5565  extracellular solute-binding protein family 1  31 
 
 		 552 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379464  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6724  extracellular solute-binding protein family 1  31.72 
 
 		 563 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3388  extracellular solute-binding protein family 1  28.9 
 
 		 547 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1437  extracellular solute-binding protein family 1  27.15 
 
 		 544 aa  147  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5755  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.58 
 
 		 544 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4040  hypothetical protein  27.37 
 
 		 567 aa  133  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1579  putative lipoprotein precursor LplA  26.7 
 
 		 552 aa  130  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0130  extracellular solute-binding protein family 1  27.89 
 
 		 561 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04170  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.09 
 
 		 547 aa  125  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.401805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05750  hypothetical protein  26.51 
 
 		 568 aa  123  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 523 aa  65.1  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 525 aa  50.4  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1990  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 366 aa  48.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  21.65 
 
 		 544 aa  47  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2335  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 		 482 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 414 aa  45.4  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1717  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 501 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 415 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 		 412 aa  44.3  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>