26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2654 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2654  sugar ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 586 aa  1205    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  32.99 
 
 		 553 aa  301  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  34.31 
 
 		 551 aa  298  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2399  extracellular solute-binding protein family 1  32.37 
 
 		 553 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000923736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3821  extracellular solute-binding protein family 1  32.88 
 
 		 553 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  32.31 
 
 		 542 aa  273  8.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  30.9 
 
 		 552 aa  249  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0369  extracellular solute-binding protein family 1  31.76 
 
 		 556 aa  239  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3323  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 		 552 aa  229  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.023879 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  28.4 
 
 		 556 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.47 
 
 		 544 aa  220  6e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01630  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.49 
 
 		 557 aa  211  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.48 
 
 		 559 aa  202  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.497394  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2662  hypothetical protein  26.05 
 
 		 557 aa  179  9e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  24.96 
 
 		 541 aa  134  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 536 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 		 559 aa  83.6  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 558 aa  80.9  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0310  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 		 566 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2052  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 		 565 aa  48.9  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2029  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  20.9 
 
 		 526 aa  47.4  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  54.29 
 
 		 440 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02830  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.44 
 
 		 537 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  22.17 
 
 		 525 aa  45.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0805  extracellular solute-binding protein  29.36 
 
 		 825 aa  44.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  26.85 
 
 		 551 aa  43.9  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.182513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>