81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0805 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0805  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 825 aa  1697    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0812  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 793 aa  251  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000378939  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1768  extracellular solute-binding protein family 5  29.52 
 
 		 579 aa  122  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 575 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.21 
 
 		 575 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.95 
 
 		 575 aa  104  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  25.33 
 
 		 575 aa  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  25.33 
 
 		 575 aa  103  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.74 
 
 		 575 aa  102  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.53 
 
 		 555 aa  102  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  25.53 
 
 		 575 aa  100  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.73 
 
 		 559 aa  100  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 575 aa  99.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  24.64 
 
 		 575 aa  95.9  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 567 aa  95.1  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.01 
 
 		 567 aa  94  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  25.72 
 
 		 580 aa  93.2  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  25.72 
 
 		 579 aa  93.2  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  25.72 
 
 		 566 aa  92.4  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  24.94 
 
 		 573 aa  89  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2906  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 574 aa  88.6  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 540 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2857  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 593 aa  72  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.358002 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1596  extracellular solute-binding protein family 5  23.72 
 
 		 572 aa  67.8  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0368881  unclonable  7.93881e-23 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 538 aa  66.6  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  26.28 
 
 		 534 aa  65.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  23.4 
 
 		 540 aa  65.1  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 		 526 aa  64.7  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  24.67 
 
 		 533 aa  63.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  24.4 
 
 		 576 aa  63.9  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3648  extracellular solute-binding protein family 5  24.44 
 
 		 556 aa  62.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1116  extracellular solute-binding protein family 5  26.11 
 
 		 592 aa  62.4  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.33 
 
 		 546 aa  60.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  22.29 
 
 		 551 aa  59.7  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  22.93 
 
 		 557 aa  59.3  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.57 
 
 		 538 aa  57.8  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 		 508 aa  55.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0725  extracellular solute-binding protein  22.42 
 
 		 556 aa  54.7  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 565 aa  54.3  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 559 aa  53.9  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  21.36 
 
 		 539 aa  53.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  29.76 
 
 		 554 aa  52  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  25.87 
 
 		 510 aa  51.6  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  22.13 
 
 		 517 aa  51.6  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0585  extracellular solute-binding protein family 5  23.53 
 
 		 628 aa  51.2  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.952367  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.22 
 
 		 589 aa  50.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  24.44 
 
 		 515 aa  50.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2203  extracellular solute-binding protein family 5  23.77 
 
 		 531 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0990  extracellular solute-binding protein  21.77 
 
 		 571 aa  50.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1009  extracellular solute-binding protein  21.77 
 
 		 571 aa  50.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1621  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.81 
 
 		 594 aa  49.3  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0614  extracellular solute-binding protein family 5  24.47 
 
 		 593 aa  48.9  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459899  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 618 aa  48.9  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.08 
 
 		 511 aa  48.9  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1115  extracellular solute-binding protein family 5  25.38 
 
 		 596 aa  48.9  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 522 aa  48.9  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  21.41 
 
 		 591 aa  48.9  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2569  ABC transporter substrate-binding protein  23.05 
 
 		 558 aa  47.8  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.49 
 
 		 511 aa  47  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  25.37 
 
 		 590 aa  47.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 512 aa  47.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 512 aa  47.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 512 aa  47.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  28.97 
 
 		 581 aa  46.2  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3349  extracellular solute-binding protein family 5  33.9 
 
 		 559 aa  47  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109598  normal  0.0359992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  21.11 
 
 		 556 aa  46.6  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  20.83 
 
 		 541 aa  47  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0133  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 576 aa  45.4  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  23.01 
 
 		 593 aa  45.4  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.49 
 
 		 511 aa  45.8  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1071  peptide ABC transporter, peptide-binding protein OppA  24.5 
 
 		 591 aa  45.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000408917  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  23.12 
 
 		 532 aa  45.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 532 aa  45.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  21.58 
 
 		 639 aa  45.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0691  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 		 600 aa  45.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0217  extracellular solute-binding protein family 5  22.29 
 
 		 588 aa  45.1  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.745298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  20.91 
 
 		 551 aa  44.7  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 509 aa  44.7  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4683  extracellular solute-binding protein  21.07 
 
 		 564 aa  44.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5265  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  40.38 
 
 		 515 aa  44.3  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154423  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3647  extracellular solute-binding protein family 5  22.51 
 
 		 556 aa  44.3  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0862095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>