More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3647 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3647  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
556 aa  1123    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0862095  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3648  extracellular solute-binding protein family 5  84.35 
 
 
556 aa  976    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1598  extracellular solute-binding protein family 5  26.81 
 
 
561 aa  164  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0732805  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  28.96 
 
 
532 aa  152  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1456  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 
532 aa  151  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  24.4 
 
 
502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.82 
 
 
504 aa  147  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 
510 aa  141  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2758  extracellular solute-binding protein family 5  26.63 
 
 
524 aa  140  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  23.85 
 
 
520 aa  139  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  26.32 
 
 
540 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 
565 aa  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0217  extracellular solute-binding protein family 5  26.75 
 
 
588 aa  136  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.745298  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.31 
 
 
510 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  24.85 
 
 
576 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 
510 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  22.38 
 
 
546 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  22.84 
 
 
517 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3692  extracellular solute-binding protein family 5  26.01 
 
 
526 aa  134  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 
515 aa  134  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.81 
 
 
505 aa  134  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  26.75 
 
 
516 aa  133  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2471  putative ABC transporter periplasmic binding protein  25.37 
 
 
530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4381  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 
510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.582693  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  24.09 
 
 
516 aa  131  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  24.65 
 
 
524 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  22.87 
 
 
498 aa  130  6e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  22.82 
 
 
505 aa  130  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.05 
 
 
525 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.36 
 
 
565 aa  130  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 
512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 
512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 
512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  23.83 
 
 
510 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.48 
 
 
511 aa  127  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 
539 aa  126  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 
510 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.34 
 
 
511 aa  125  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.93 
 
 
506 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 
509 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  24.78 
 
 
508 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  25.68 
 
 
557 aa  124  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 
505 aa  124  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 
509 aa  123  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 
507 aa  123  9e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2267  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 
506 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 
551 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 
540 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 
490 aa  122  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4234  extracellular solute-binding protein  21.94 
 
 
535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  24.61 
 
 
523 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.92 
 
 
511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2671  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 
542 aa  121  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.699901  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 
540 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4557  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.29 
 
 
535 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.22 
 
 
511 aa  121  3.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 
511 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3507  extracellular solute-binding protein family 5  26.62 
 
 
510 aa  120  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48060  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 
525 aa  120  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.54 
 
 
538 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0816  extracellular solute-binding protein  21.94 
 
 
533 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3283  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 
545 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5632  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2498  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 
547 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  25.43 
 
 
563 aa  118  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  25.74 
 
 
540 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5538  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 
528 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332617  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1271  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.41 
 
 
528 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000259921  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  22.09 
 
 
559 aa  117  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  21.91 
 
 
532 aa  117  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.83 
 
 
511 aa  117  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  25.65 
 
 
532 aa  116  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  22.86 
 
 
533 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6093  putative dipeptide ABC transporter binding protein subunit  24.95 
 
 
526 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.500432  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 
532 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  24.37 
 
 
527 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  22.77 
 
 
531 aa  116  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 
545 aa  116  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  21.62 
 
 
535 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  21.62 
 
 
535 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  21.62 
 
 
535 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  21.62 
 
 
535 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  21.62 
 
 
535 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  25.05 
 
 
540 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 
530 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  21.62 
 
 
535 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  28.05 
 
 
497 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  21.62 
 
 
535 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.72 
 
 
518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  24.03 
 
 
534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  22.16 
 
 
531 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  21.43 
 
 
535 aa  115  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  24.16 
 
 
495 aa  115  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 
513 aa  115  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 
509 aa  115  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3630  extracellular solute-binding protein family 5  26.68 
 
 
514 aa  115  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2906  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 
574 aa  115  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4734  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 
521 aa  115  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676308  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  21.69 
 
 
521 aa  114  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  21.69 
 
 
521 aa  114  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  21.69 
 
 
521 aa  114  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>