More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3805 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  80.51 
 
 		 569 aa  903    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 590 aa  1216    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  34.33 
 
 		 551 aa  286  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0917  extracellular solute-binding protein family 5  32.08 
 
 		 592 aa  261  2e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.340529 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 		 580 aa  242  2e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  28.5 
 
 		 567 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  30.24 
 
 		 576 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  26.67 
 
 		 591 aa  173  7.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 555 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 555 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 554 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  26.56 
 
 		 566 aa  170  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 558 aa  170  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 		 550 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  27.64 
 
 		 578 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  25.53 
 
 		 570 aa  158  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.26 
 
 		 579 aa  151  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  26.13 
 
 		 568 aa  137  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  24.2 
 
 		 567 aa  138  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 563 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.5 
 
 		 586 aa  115  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 581 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  23.28 
 
 		 565 aa  107  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  22.61 
 
 		 519 aa  100  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 639 aa  100  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  25.17 
 
 		 585 aa  94.4  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  23.56 
 
 		 545 aa  91.7  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  24.4 
 
 		 597 aa  90.5  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  26.46 
 
 		 524 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  23.17 
 
 		 556 aa  88.2  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  26.9 
 
 		 562 aa  87.8  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0337  extracellular solute-binding protein family 5  26.91 
 
 		 521 aa  87.4  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0461  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 520 aa  87.4  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.05 
 
 		 524 aa  87.4  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1271  extracellular solute-binding protein family 5  26.96 
 
 		 533 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000259985  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  25.66 
 
 		 557 aa  85.9  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4535  extracellular solute-binding protein family 5  24.3 
 
 		 567 aa  83.6  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2164  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 599 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.10806 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.21 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2203  extracellular solute-binding protein family 5  26.79 
 
 		 549 aa  80.5  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1103  extracellular solute-binding protein family 5  28.05 
 
 		 524 aa  80.1  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3920  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 523 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.407855  normal  0.0244216 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.06 
 
 		 622 aa  80.1  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 617 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  22.79 
 
 		 546 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  24.64 
 
 		 526 aa  77.8  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 508 aa  77.8  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  24.64 
 
 		 526 aa  77.8  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0218  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 537 aa  77.8  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.219975  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1145  extracellular solute-binding protein family 5  26.28 
 
 		 622 aa  77.4  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0845067  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 566 aa  77  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 544 aa  77  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5556  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 522 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.662967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6358  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 519 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 534 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  22.08 
 
 		 512 aa  75.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  28.62 
 
 		 576 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  21.94 
 
 		 527 aa  75.9  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.58 
 
 		 520 aa  75.1  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 556 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 		 512 aa  74.7  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  23.87 
 
 		 614 aa  74.7  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.52 
 
 		 527 aa  74.3  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 534 aa  74.3  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  24.12 
 
 		 604 aa  73.9  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.38 
 
 		 593 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  22.89 
 
 		 569 aa  73.6  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0725  extracellular solute-binding protein  20.79 
 
 		 556 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0217  extracellular solute-binding protein family 5  23.7 
 
 		 588 aa  73.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.745298  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.38 
 
 		 593 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0360  extracellular solute-binding protein family 5  23.39 
 
 		 506 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  24.69 
 
 		 605 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 592 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 517 aa  72.8  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.48 
 
 		 575 aa  72  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4816  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  24.07 
 
 		 524 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  21.57 
 
 		 567 aa  72  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  21.54 
 
 		 532 aa  72  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.34 
 
 		 509 aa  72  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  23.32 
 
 		 603 aa  72  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  23.02 
 
 		 517 aa  72  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  24.77 
 
 		 622 aa  71.6  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  27.66 
 
 		 547 aa  71.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1771  extracellular solute-binding protein family 5  24 
 
 		 547 aa  71.2  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  21.96 
 
 		 589 aa  71.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.09 
 
 		 538 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  23.45 
 
 		 513 aa  71.2  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3845  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  23.73 
 
 		 524 aa  70.9  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0689  extracellular solute-binding protein family 5  24 
 
 		 544 aa  70.9  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1933  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 		 505 aa  70.9  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3291  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 519 aa  70.9  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3675  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  23.6 
 
 		 524 aa  70.9  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  22.6 
 
 		 522 aa  70.9  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.597639 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03325  nickel transporter subunit  23.6 
 
 		 524 aa  70.5  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  24.8 
 
 		 544 aa  70.5  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3958  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  23.6 
 
 		 524 aa  70.5  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0240  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  23.6 
 
 		 524 aa  70.5  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7448  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.67 
 
 		 626 aa  70.5  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 		 565 aa  70.5  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4213  4-phytase  24.93 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.798604  normal  0.63897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>