141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0812 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0812  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
793 aa  1615    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000378939  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0805  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 
825 aa  251  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  25.78 
 
 
580 aa  100  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  25.57 
 
 
579 aa  100  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1768  extracellular solute-binding protein family 5  26.03 
 
 
579 aa  96.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2906  extracellular solute-binding protein family 5  26.07 
 
 
574 aa  89  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 
575 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  26.21 
 
 
557 aa  84  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  25.13 
 
 
573 aa  82.4  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.54 
 
 
575 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  26.54 
 
 
575 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.07 
 
 
559 aa  78.2  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.54 
 
 
575 aa  78.2  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.07 
 
 
555 aa  77.8  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  25.89 
 
 
575 aa  77.8  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.84 
 
 
575 aa  77.4  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 
567 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  26.25 
 
 
575 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  26.25 
 
 
575 aa  75.1  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.95 
 
 
567 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 
575 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  24.03 
 
 
566 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1596  extracellular solute-binding protein family 5  24.73 
 
 
572 aa  70.9  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0368881  unclonable  7.93881e-23 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2857  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 
593 aa  69.3  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.358002 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  22.92 
 
 
534 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
509 aa  65.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  21.01 
 
 
533 aa  62.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  22.87 
 
 
546 aa  61.2  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1752  extracellular solute-binding protein family 5  21.99 
 
 
582 aa  61.2  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0990  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 
571 aa  60.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1009  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 
571 aa  60.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0494  extracellular solute-binding protein family 5  45.76 
 
 
536 aa  58.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.080678  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.22 
 
 
511 aa  58.2  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  21.91 
 
 
563 aa  58.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  21.71 
 
 
622 aa  57.8  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  24.01 
 
 
510 aa  57.4  0.0000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2758  extracellular solute-binding protein family 5  23.78 
 
 
524 aa  57.8  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.23 
 
 
509 aa  57.4  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.36 
 
 
511 aa  57  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 
509 aa  57  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  23.27 
 
 
515 aa  56.2  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  22.93 
 
 
518 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  20.51 
 
 
539 aa  55.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 
531 aa  54.7  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  21.7 
 
 
525 aa  54.3  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 
541 aa  54.3  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  20.44 
 
 
540 aa  54.3  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1718  extracellular solute-binding protein family 5  21.8 
 
 
581 aa  54.3  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264997  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 
498 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.01 
 
 
525 aa  53.5  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  23.84 
 
 
531 aa  53.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  26.77 
 
 
565 aa  53.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 
510 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2700  ABC transporter substrate binding protein (agrocinopine)  32.43 
 
 
521 aa  52.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  19.35 
 
 
556 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.36 
 
 
511 aa  52.4  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  21.23 
 
 
508 aa  52.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  22.25 
 
 
562 aa  52.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  24.38 
 
 
521 aa  52.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.38 
 
 
521 aa  52.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.38 
 
 
521 aa  52  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  19.77 
 
 
540 aa  52  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5018  extracellular solute-binding protein family 5  35.29 
 
 
526 aa  52.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0327585 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  24.38 
 
 
521 aa  52.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 
521 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 
618 aa  52  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 
534 aa  52  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 
534 aa  52  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  20.39 
 
 
554 aa  51.6  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  20.9 
 
 
505 aa  51.2  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.08 
 
 
511 aa  51.2  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 
531 aa  50.8  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  19.61 
 
 
538 aa  50.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  22.47 
 
 
531 aa  50.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  25.41 
 
 
593 aa  50.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  25.66 
 
 
544 aa  49.3  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 
516 aa  49.3  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 
591 aa  48.9  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1116  extracellular solute-binding protein family 5  21.66 
 
 
592 aa  49.3  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1612  extracellular solute-binding protein family 5  31.48 
 
 
549 aa  48.9  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.56 
 
 
593 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  21.84 
 
 
565 aa  48.5  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1860  extracellular solute-binding protein family 5  26.42 
 
 
544 aa  48.5  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.44883  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2342  extracellular solute-binding protein family 5  21.53 
 
 
580 aa  48.5  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  21.57 
 
 
576 aa  48.1  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3741  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 
623 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  20.22 
 
 
544 aa  48.1  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0187  extracellular solute-binding protein  20.94 
 
 
529 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000120375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  20.92 
 
 
553 aa  47.8  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 
515 aa  47.8  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  22.69 
 
 
520 aa  47.8  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.31 
 
 
593 aa  47  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.27 
 
 
529 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.67 
 
 
592 aa  47  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.15 
 
 
589 aa  47.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  19.72 
 
 
538 aa  47  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2629  extracellular solute-binding protein  20.8 
 
 
550 aa  47  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.553559  normal  0.405199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 
617 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 
531 aa  47.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  22.95 
 
 
517 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>