More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3648 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013923  Nmag_3648  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 556 aa  1125    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3647  extracellular solute-binding protein family 5  84.35 
 
 		 556 aa  941    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0862095  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  29.14 
 
 		 516 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  28.46 
 
 		 532 aa  153  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1598  extracellular solute-binding protein family 5  26.85 
 
 		 561 aa  150  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0732805  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  25.2 
 
 		 502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 515 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 498 aa  145  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.78 
 
 		 510 aa  144  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 512 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 512 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 512 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 510 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  23.25 
 
 		 546 aa  140  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1456  extracellular solute-binding protein family 5  26.11 
 
 		 532 aa  140  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 510 aa  140  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2471  putative ABC transporter periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 530 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10018 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.06 
 
 		 504 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2758  extracellular solute-binding protein family 5  26 
 
 		 524 aa  138  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 509 aa  137  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.97 
 
 		 511 aa  134  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  27.61 
 
 		 523 aa  134  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4234  extracellular solute-binding protein  23.52 
 
 		 535 aa  134  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4557  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.41 
 
 		 535 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  25.26 
 
 		 540 aa  133  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4381  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 		 510 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.582693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2671  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 542 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.699901  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  23.71 
 
 		 520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0816  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 505 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 		 565 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.5 
 
 		 565 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  23.62 
 
 		 524 aa  130  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2498  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 547 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.24 
 
 		 511 aa  130  7.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.98 
 
 		 511 aa  130  9.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.54 
 
 		 525 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  24.3 
 
 		 576 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  23.84 
 
 		 516 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  24.71 
 
 		 508 aa  128  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.11 
 
 		 512 aa  128  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  22.37 
 
 		 505 aa  127  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3283  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 545 aa  127  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5632  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.19 
 
 		 509 aa  127  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3692  extracellular solute-binding protein family 5  25.14 
 
 		 526 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  23.67 
 
 		 505 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 511 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 509 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  22.4 
 
 		 532 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  23.12 
 
 		 527 aa  124  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1271  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.24 
 
 		 528 aa  124  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000259921  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  24.8 
 
 		 532 aa  124  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  27.78 
 
 		 497 aa  123  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 515 aa  124  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  27.26 
 
 		 557 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  23.63 
 
 		 532 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.28 
 
 		 511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 		 510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  22.35 
 
 		 490 aa  121  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  20.83 
 
 		 517 aa  122  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 539 aa  121  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 532 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.49 
 
 		 511 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0217  extracellular solute-binding protein family 5  26.15 
 
 		 588 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.745298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  22.22 
 
 		 510 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 530 aa  120  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  23.74 
 
 		 495 aa  120  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  23.12 
 
 		 531 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  22.5 
 
 		 529 aa  120  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  22.78 
 
 		 535 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.21 
 
 		 506 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 532 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48060  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 525 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3102  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 549 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.522775  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 		 551 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 		 559 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  22.78 
 
 		 535 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  22.78 
 
 		 535 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  22.78 
 
 		 535 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  22.85 
 
 		 533 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2267  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 506 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  22.78 
 
 		 535 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  22.78 
 
 		 535 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  22.78 
 
 		 535 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  23.29 
 
 		 531 aa  118  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  22.59 
 
 		 535 aa  118  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12520  dipeptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding component  25.29 
 
 		 537 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0296833  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5538  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 528 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332617  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 540 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  22.63 
 
 		 551 aa  117  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 545 aa  117  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 507 aa  117  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  24.21 
 
 		 527 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5193  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 529 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0587295  normal  0.27415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6093  putative dipeptide ABC transporter binding protein subunit  23.95 
 
 		 526 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.500432  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 521 aa  117  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  22.04 
 
 		 541 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.25 
 
 		 538 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0844  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 531 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 		 538 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>