245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3366 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3366  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 441 aa  908    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1463  extracellular solute-binding protein family 1  79.73 
 
 		 444 aa  732    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0942  extracellular solute-binding protein  41.03 
 
 		 418 aa  290  4e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.254009  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1634  extracellular solute-binding protein  36.05 
 
 		 428 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1527  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  36.05 
 
 		 428 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 		 441 aa  160  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3895  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 433 aa  127  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3157  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0206164  normal  0.300299 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2274  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 		 428 aa  114  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 466 aa  89.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04930  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.47 
 
 		 442 aa  89.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.4 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  22.6 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  21.36 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  21.36 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  21.8 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0770  extracellular solute-binding protein family 1  22.92 
 
 		 444 aa  72.8  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  22.55 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 458 aa  70.5  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  21.24 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  21.95 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  21.13 
 
 		 461 aa  66.6  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  22.2 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  25.56 
 
 		 553 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  20.77 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2418  extracellular solute-binding protein family 1  21.65 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  21.83 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  21.96 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0174  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 951 aa  62.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.01491  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  22.88 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1085  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.474529 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1617  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  21.52 
 
 		 468 aa  60.5  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4566  extracellular solute-binding protein  20.9 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 		 450 aa  60.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  21.5 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  19.78 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  22.55 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  21.67 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  21.09 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  22.16 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2627  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00662506  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0125  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  24.08 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  22.88 
 
 		 441 aa  57  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 		 556 aa  56.6  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2055  extracellular solute-binding protein  21.96 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.822621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  21.18 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 		 458 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  23.39 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.22 
 
 		 453 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  21.38 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  21.31 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 416 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  22.49 
 
 		 438 aa  54.3  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 		 454 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0986  extracellular solute-binding protein  21.98 
 
 		 449 aa  53.9  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.265801 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2799  extracellular solute-binding protein  21.15 
 
 		 453 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.357786  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  21.97 
 
 		 411 aa  53.9  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 432 aa  53.9  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  25.23 
 
 		 461 aa  53.5  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  20.41 
 
 		 424 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3732  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  24.81 
 
 		 438 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0606  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  22.65 
 
 		 458 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  20.48 
 
 		 421 aa  53.1  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1638  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  19.23 
 
 		 434 aa  53.1  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000325816  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03302  glycerol-3-phosphate transporter subunit  24.29 
 
 		 438 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0262  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 438 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  21.71 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2535  extracellular solute-binding protein family 1  22.02 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.105932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  21.81 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  29.73 
 
 		 448 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  21.6 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4767  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  24.29 
 
 		 438 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.552805 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1865  extracellular solute-binding protein  22.41 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  21.72 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0117  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  23.85 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03255  hypothetical protein  24.29 
 
 		 438 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0263  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  24.29 
 
 		 438 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0475  extracellular solute-binding protein family 1  18.7 
 
 		 397 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3650  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  24.29 
 
 		 438 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>