188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1463 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3366  extracellular solute-binding protein family 1  79.73 
 
 		 441 aa  730    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1463  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 444 aa  900    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0942  extracellular solute-binding protein  41.26 
 
 		 418 aa  291  1e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.254009  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1527  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  37.39 
 
 		 428 aa  259  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1634  extracellular solute-binding protein  37.39 
 
 		 428 aa  259  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  27.82 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3895  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 433 aa  113  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2274  extracellular solute-binding protein family 1  22.97 
 
 		 428 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3157  extracellular solute-binding protein family 1  25.65 
 
 		 429 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0206164  normal  0.300299 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.14 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04930  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.86 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 466 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  22.11 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  22.39 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  22.89 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  21.29 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  20.89 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  22.52 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  22.25 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  21.36 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  21.36 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2627  extracellular solute-binding protein family 1  25.35 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00662506  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  22.11 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4566  extracellular solute-binding protein  21.29 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  21.24 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  21.44 
 
 		 424 aa  59.7  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1283  extracellular solute-binding lipoprotein, putative  29.67 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6664  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3323  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 552 aa  57.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.023879 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  25.15 
 
 		 553 aa  57.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0174  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 951 aa  56.6  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.01491  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0770  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  22.52 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  22.47 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  22.47 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  22.89 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  22.07 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  20.89 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 556 aa  55.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5331  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  22.85 
 
 		 431 aa  55.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.998389  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 468 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 416 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  21.91 
 
 		 411 aa  55.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.35 
 
 		 438 aa  54.3  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  21.91 
 
 		 411 aa  54.3  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 411 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 		 432 aa  53.5  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3553  hypothetical protein  20.44 
 
 		 427 aa  53.5  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0113  extracellular solute-binding protein  22.53 
 
 		 455 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.270734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 442 aa  53.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  22.81 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2799  extracellular solute-binding protein  20.33 
 
 		 453 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.357786  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  21.96 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  20.39 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2013  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.991542  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.12 
 
 		 453 aa  51.6  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.43 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  22.76 
 
 		 420 aa  51.6  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 447 aa  51.2  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  20.39 
 
 		 442 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  22.29 
 
 		 450 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0061  extracellular solute-binding protein family 1  22.87 
 
 		 462 aa  50.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01630  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.97 
 
 		 557 aa  50.4  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 407 aa  50.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  22.06 
 
 		 459 aa  50.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  20.7 
 
 		 421 aa  50.1  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 415 aa  50.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0080  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.66 
 
 		 442 aa  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.96 
 
 		 439 aa  50.1  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  23.35 
 
 		 424 aa  50.1  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 419 aa  50.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 		 448 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  20.83 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  22.79 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6261  extracellular solute-binding protein family 1  20.56 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.689417 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2709  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  30 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  25.46 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>