182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1527 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1527  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  100 
 
 		 428 aa  891    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1634  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 428 aa  891    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0942  extracellular solute-binding protein  50 
 
 		 418 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.254009  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3366  extracellular solute-binding protein family 1  35.98 
 
 		 441 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1463  extracellular solute-binding protein family 1  37.59 
 
 		 444 aa  253  6e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  26.75 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2274  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 428 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3157  extracellular solute-binding protein family 1  29.81 
 
 		 429 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0206164  normal  0.300299 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3895  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04930  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.98 
 
 		 442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 399 aa  103  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3553  hypothetical protein  21.45 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5331  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  20.68 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.998389  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  23.84 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  21.9 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  21.14 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  21.61 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  21.61 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 		 420 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1594  extracellular solute-binding protein family 1  22.55 
 
 		 961 aa  64.7  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  22.96 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  21.7 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  23.79 
 
 		 445 aa  63.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  22.33 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  21.38 
 
 		 461 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  22.12 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0631  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  22.4 
 
 		 468 aa  60.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0174  extracellular solute-binding protein family 1  22.91 
 
 		 951 aa  60.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.01491  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  21.62 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  20.62 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0845  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  20.62 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  22.26 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 434 aa  57  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  22.76 
 
 		 443 aa  57  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  19.8 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  20.5 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  20.05 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0637  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 		 425 aa  56.2  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.27 
 
 		 419 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 504 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  20.85 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.07 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  23.57 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 		 425 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  20.6 
 
 		 436 aa  53.9  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  22.79 
 
 		 403 aa  54.3  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 424 aa  53.9  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 434 aa  53.1  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  22.12 
 
 		 437 aa  53.1  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 		 453 aa  53.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  22.28 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01220  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.56 
 
 		 466 aa  52.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.21 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4138  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  22.45 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00348898  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4064  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein, putative  22.45 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0421403  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  19.67 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  20.91 
 
 		 422 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  19.67 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3922  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  22.45 
 
 		 419 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0134813  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3754  maltose-maltodextrin ABC-related solute binding protein  22.45 
 
 		 419 aa  51.2  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000542287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3770  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  22.45 
 
 		 419 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000087749  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4229  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  22.45 
 
 		 419 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  24.4 
 
 		 461 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  21.79 
 
 		 423 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 432 aa  50.8  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4032  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  22.45 
 
 		 419 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 		 404 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  22.81 
 
 		 410 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2418  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 		 447 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0476  extracellular solute-binding protein family 1  22.17 
 
 		 401 aa  50.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2714  extracellular solute-binding protein  22.05 
 
 		 419 aa  50.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182746  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  24.4 
 
 		 461 aa  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 432 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  20 
 
 		 441 aa  50.1  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4119  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  22.11 
 
 		 419 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000674051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  23.03 
 
 		 419 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  20.73 
 
 		 426 aa  50.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3841  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000013033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>