165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0503 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0503  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 443 aa  906    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000478191  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1174  extracellular solute-binding protein  44.52 
 
 		 502 aa  350  3e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2071  twin-arginine translocation pathway signal  35.09 
 
 		 471 aa  265  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.170531  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1345  extracellular solute-binding protein family 1  31.96 
 
 		 456 aa  232  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.021804  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4126  extracellular solute-binding protein family 1  32.05 
 
 		 456 aa  230  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.738673  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6130  extracellular solute-binding protein family 1  32.13 
 
 		 448 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.307957  normal  0.305862 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6542  extracellular solute-binding protein family 1  32.57 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162087 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5250  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  30.85 
 
 		 457 aa  216  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.467726  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2378  extracellular solute-binding protein  22.55 
 
 		 451 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612639  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  30.1 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  27.95 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.57 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 		 443 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  30.3 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  19.85 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2799  extracellular solute-binding protein  22.75 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.357786  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15380  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.01 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.479356  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  21.41 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 443 aa  57  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  29.52 
 
 		 444 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  22.11 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0508  extracellular solute-binding protein family 1  27.81 
 
 		 514 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 		 447 aa  55.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  23.49 
 
 		 436 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.78 
 
 		 435 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2551  extracellular solute-binding protein family 1  35.71 
 
 		 473 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35345  normal  0.255178 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 		 432 aa  54.3  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 		 446 aa  53.9  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  29.8 
 
 		 441 aa  53.9  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 		 443 aa  53.5  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  34.83 
 
 		 397 aa  53.5  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  20 
 
 		 418 aa  53.5  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  21.2 
 
 		 425 aa  53.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 		 425 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 437 aa  53.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  20.58 
 
 		 443 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1150  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344094  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  23.24 
 
 		 421 aa  52.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  20.58 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 415 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  20.58 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1046  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  30.57 
 
 		 445 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1380  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 		 453 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  22.88 
 
 		 428 aa  51.6  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  21.62 
 
 		 427 aa  51.2  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 437 aa  51.2  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  18.56 
 
 		 424 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  20.4 
 
 		 427 aa  50.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 435 aa  50.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 400 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  21.61 
 
 		 425 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 440 aa  50.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 432 aa  50.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 410 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 412 aa  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.81 
 
 		 410 aa  50.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  29.21 
 
 		 449 aa  50.1  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.66 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  21.82 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  22.75 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  22.15 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2511  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  21.92 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.98381  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 		 457 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3075  sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  25.71 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.111769 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  22.78 
 
 		 432 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  21.53 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1410  extracellular solute-binding protein family 1  33.64 
 
 		 482 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  21.63 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.87 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 		 392 aa  47.8  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 		 451 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0473  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 		 420 aa  48.5  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 400 aa  48.5  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3595  extracellular solute-binding protein family 1  31.78 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 		 392 aa  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.39 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 433 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3000  extracellular solute-binding protein family 1  20.9 
 
 		 450 aa  47.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0889  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0829  extracellular solute-binding protein family 1  29.84 
 
 		 465 aa  47.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2977  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.576527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 400 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 		 434 aa  47.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 		 421 aa  47  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 391 aa  47  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 		 434 aa  47  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 397 aa  47.4  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  22.88 
 
 		 431 aa  47  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3027  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 		 467 aa  47  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>