217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4126 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1345  extracellular solute-binding protein family 1  89.04 
 
 		 456 aa  823    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.021804  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4126  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 456 aa  941    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.738673  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5250  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  66.81 
 
 		 457 aa  633  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.467726  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0503  extracellular solute-binding protein  32.18 
 
 		 443 aa  237  4e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000478191  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1174  extracellular solute-binding protein  32.56 
 
 		 502 aa  234  3e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6130  extracellular solute-binding protein family 1  30.04 
 
 		 448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.307957  normal  0.305862 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6542  extracellular solute-binding protein family 1  30.66 
 
 		 448 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162087 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2071  twin-arginine translocation pathway signal  30.25 
 
 		 471 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.170531  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  23.25 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.8 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  28.5 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.63 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0940  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.99 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  38.89 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  22.16 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1317  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 426 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  21.89 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  37.33 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2244  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.846858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  25.1 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 488 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  20.44 
 
 		 464 aa  57  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 424 aa  57  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  24.9 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2551  extracellular solute-binding protein family 1  36.14 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35345  normal  0.255178 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  21 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  23.39 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.95 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.95 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 436 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.91 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 433 aa  55.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 		 422 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 437 aa  55.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  21.43 
 
 		 415 aa  55.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5891  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 		 402 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.403986 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.48 
 
 		 438 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 		 411 aa  55.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 417 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  21.68 
 
 		 425 aa  53.9  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 		 424 aa  53.9  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  34.52 
 
 		 430 aa  53.9  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 		 432 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  35.63 
 
 		 440 aa  53.5  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  34.52 
 
 		 430 aa  53.9  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03697  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.47 
 
 		 675 aa  53.5  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  20.53 
 
 		 410 aa  53.5  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 437 aa  53.5  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  35.62 
 
 		 419 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 400 aa  53.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 391 aa  53.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 437 aa  53.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  22.99 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  30.58 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001328  maltose/maltodextrin ABC transporter substrate binding periplasmic protein MalE  22.53 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 403 aa  51.6  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 411 aa  51.2  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12290  maltose-binding periplasmic protein  32.94 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 391 aa  51.2  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.47 
 
 		 430 aa  51.2  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 420 aa  50.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 457 aa  50.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 420 aa  50.8  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03790  maltose-binding periplasmic protein  23.08 
 
 		 467 aa  50.4  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0386362 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  21.54 
 
 		 401 aa  50.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  20.65 
 
 		 421 aa  50.4  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3841  extracellular solute-binding protein  34.25 
 
 		 419 aa  50.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000013033  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1410  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 482 aa  50.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0744  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 432 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0587531  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 440 aa  50.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  28.37 
 
 		 480 aa  50.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 		 445 aa  50.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3922  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  35.62 
 
 		 419 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0134813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4229  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  35.62 
 
 		 419 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 434 aa  50.1  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  20.16 
 
 		 432 aa  50.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  34.26 
 
 		 413 aa  50.1  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4032  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  35.62 
 
 		 419 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3754  maltose-maltodextrin ABC-related solute binding protein  35.62 
 
 		 419 aa  50.1  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000542287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3770  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  35.62 
 
 		 419 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000087749  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5872  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.86 
 
 		 460 aa  50.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.696543 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 432 aa  50.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4138  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  35.62 
 
 		 419 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00348898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>