206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1345 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4126  extracellular solute-binding protein family 1  89.04 
 
 		 456 aa  815    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.738673  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1345  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 456 aa  941    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.021804  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5250  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  65.93 
 
 		 457 aa  625  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.467726  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0503  extracellular solute-binding protein  32.61 
 
 		 443 aa  240  4e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000478191  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1174  extracellular solute-binding protein  32.56 
 
 		 502 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2071  twin-arginine translocation pathway signal  28.37 
 
 		 471 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.170531  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6130  extracellular solute-binding protein family 1  28.95 
 
 		 448 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.307957  normal  0.305862 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6542  extracellular solute-binding protein family 1  29.48 
 
 		 448 aa  163  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162087 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  30.08 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0940  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.36 
 
 		 409 aa  67  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.8 
 
 		 426 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  21.76 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2244  extracellular solute-binding protein family 1  29.38 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.846858 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 		 421 aa  57  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  28.09 
 
 		 419 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 488 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 443 aa  57  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0744  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0587531  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1410  extracellular solute-binding protein family 1  31.93 
 
 		 482 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  21.23 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 488 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  24.33 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2551  extracellular solute-binding protein family 1  34.94 
 
 		 473 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35345  normal  0.255178 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  26.38 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  37.33 
 
 		 415 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  22.53 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 446 aa  55.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  21.78 
 
 		 425 aa  55.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.5 
 
 		 431 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03697  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.95 
 
 		 675 aa  54.3  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 421 aa  54.3  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 457 aa  53.9  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  29.59 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  23.63 
 
 		 440 aa  53.9  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 410 aa  53.9  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 435 aa  53.9  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0294  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.22 
 
 		 406 aa  53.9  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.491527  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.1 
 
 		 422 aa  53.5  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.1 
 
 		 422 aa  53.5  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3841  extracellular solute-binding protein  36.99 
 
 		 419 aa  53.1  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000013033  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  34.52 
 
 		 430 aa  53.1  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  34.52 
 
 		 430 aa  53.1  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4032  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  38.36 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3922  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  38.36 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0134813  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3754  maltose-maltodextrin ABC-related solute binding protein  38.36 
 
 		 419 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000542287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3770  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  38.36 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000087749  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4229  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  38.36 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.99 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 401 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  36.11 
 
 		 464 aa  53.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1317  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4138  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  38.36 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00348898  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  35.63 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4064  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein, putative  36.99 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0421403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4119  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  38.36 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000674051  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 		 424 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03790  maltose-binding periplasmic protein  23.81 
 
 		 467 aa  51.6  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0386362 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 420 aa  51.6  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.88 
 
 		 411 aa  51.2  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12290  maltose-binding periplasmic protein  34.02 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 411 aa  51.2  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.88 
 
 		 366 aa  51.2  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 411 aa  51.2  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 		 432 aa  50.8  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 441 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  21.08 
 
 		 438 aa  50.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 417 aa  50.4  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 395 aa  50.4  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  38.57 
 
 		 440 aa  50.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 		 429 aa  50.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  37.97 
 
 		 449 aa  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  22.81 
 
 		 411 aa  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  31.87 
 
 		 392 aa  50.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  31.87 
 
 		 392 aa  50.4  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5891  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 402 aa  50.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.403986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 444 aa  50.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 410 aa  50.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1500  extracellular solute-binding protein  34.95 
 
 		 393 aa  50.1  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0894  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 470 aa  50.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.444762  normal  0.144357 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001328  maltose/maltodextrin ABC transporter substrate binding periplasmic protein MalE  25.68 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  22.63 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05214  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.68 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>