115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1174 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1174  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 502 aa  1030    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0503  extracellular solute-binding protein  44.52 
 
 		 443 aa  351  1e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000478191  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2071  twin-arginine translocation pathway signal  35.31 
 
 		 471 aa  256  8e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.170531  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1345  extracellular solute-binding protein family 1  32.28 
 
 		 456 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.021804  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4126  extracellular solute-binding protein family 1  32.56 
 
 		 456 aa  234  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.738673  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5250  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  32.47 
 
 		 457 aa  230  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.467726  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6130  extracellular solute-binding protein family 1  32.64 
 
 		 448 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.307957  normal  0.305862 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6542  extracellular solute-binding protein family 1  32.64 
 
 		 448 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162087 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  21.72 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5365  extracellular solute-binding protein family 1  29.89 
 
 		 418 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.559287 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  22.79 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 488 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 422 aa  63.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  28.99 
 
 		 445 aa  62  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2014  extracellular solute-binding protein family 1  23.04 
 
 		 455 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.383085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2378  extracellular solute-binding protein  21.9 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612639  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4758  extracellular solute-binding protein family 1  29.31 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 		 488 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  21.46 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  21.3 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1410  extracellular solute-binding protein family 1  30.85 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  21.06 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  22.07 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1722  extracellular solute-binding protein family 1  32.26 
 
 		 476 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.902381 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  21.2 
 
 		 429 aa  55.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  23.35 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2551  extracellular solute-binding protein family 1  30.43 
 
 		 473 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35345  normal  0.255178 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  22.42 
 
 		 421 aa  54.7  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  20.88 
 
 		 415 aa  54.3  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 		 420 aa  53.9  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  21.32 
 
 		 427 aa  54.3  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 403 aa  53.9  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  28.03 
 
 		 414 aa  53.9  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  27.33 
 
 		 446 aa  53.5  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  29.5 
 
 		 419 aa  53.5  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.08 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3000  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 450 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 422 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  20.61 
 
 		 437 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 503 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 412 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 		 493 aa  52  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  28.23 
 
 		 397 aa  51.2  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 		 442 aa  51.2  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  29.67 
 
 		 449 aa  51.2  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2064  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 449 aa  50.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  34.88 
 
 		 440 aa  50.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 		 443 aa  51.2  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3387  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 447 aa  50.8  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4863  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 492 aa  50.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.426159 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 		 428 aa  50.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  31.63 
 
 		 455 aa  50.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 		 434 aa  50.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1459  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.32 
 
 		 457 aa  49.7  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0175  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1269  extracellular solute-binding protein family 1  30.19 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 415 aa  49.3  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3669  extracellular solute-binding protein family 1  23.35 
 
 		 492 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  21.39 
 
 		 412 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.02 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  21.49 
 
 		 436 aa  48.5  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  31.46 
 
 		 447 aa  48.5  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  32.99 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0476  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 428 aa  48.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  30.82 
 
 		 415 aa  48.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  31.51 
 
 		 419 aa  48.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 464 aa  48.1  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 422 aa  47.8  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  30.1 
 
 		 435 aa  47.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  19.06 
 
 		 399 aa  47.4  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5872  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.57 
 
 		 460 aa  47.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.696543 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  25 
 
 		 421 aa  47  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 		 443 aa  47  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  22.14 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0974  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606433  normal  0.163223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  28.33 
 
 		 422 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2511  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  30.39 
 
 		 425 aa  45.8  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.98381  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 		 448 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.64 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  27.96 
 
 		 460 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  25 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.98 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  21.47 
 
 		 427 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0630  extracellular solute-binding protein family 1  29.55 
 
 		 410 aa  44.7  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505283 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 390 aa  44.7  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>