More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1317 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1317  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 426 aa  877    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  60.9 
 
 		 440 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  58.68 
 
 		 443 aa  535  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  27.71 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  29.6 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  26.92 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  26.92 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  26.53 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  28.78 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 		 449 aa  67.8  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  32.68 
 
 		 414 aa  67  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.94 
 
 		 428 aa  67  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  25.22 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.76 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.92 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0968  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3883  maltose/maltodextrin ABC transporter periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  24.86 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.265603 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0914  maltose/maltodextrin ABC transporter, periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  25.51 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.459005  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  35.71 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0059  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4126  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.738673  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  26.41 
 
 		 438 aa  59.7  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 420 aa  59.7  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2659  extracellular solute-binding protein family 1  21.27 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00136924  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  22.33 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  29.27 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  29.27 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.25 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  36.04 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3306  extracellular solute-binding protein  21.27 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  27.81 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  33.93 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  24.9 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  29.81 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  21.82 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  27.98 
 
 		 434 aa  57  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.08 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  33.65 
 
 		 415 aa  57  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  22.35 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7341  sugar ABC transporter sugar-binding protein  25.78 
 
 		 426 aa  56.6  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  26.42 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 433 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.71 
 
 		 380 aa  56.2  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 		 420 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 		 442 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  21.19 
 
 		 441 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2588  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000485668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2014  extracellular solute-binding protein family 1  26.59 
 
 		 455 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.383085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  20.75 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 		 422 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6933  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.4 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0038808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  22.14 
 
 		 451 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5250  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.22 
 
 		 457 aa  54.7  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.467726  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  22.77 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  33.62 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0237  extracellular solute-binding protein family 1  28.97 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 		 420 aa  54.3  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  22.03 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0178  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 		 449 aa  53.9  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>