129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1619 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1619  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 450 aa  921    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4188  extracellular solute-binding protein  22.01 
 
 		 465 aa  96.7  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0068  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 		 486 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6832  putative ABC transporter substrate-binding protein  22.89 
 
 		 460 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0145789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  25.47 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0531  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2892  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 436 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.65 
 
 		 438 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0822  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1413  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3687  extracellular solute-binding protein family 1  20.79 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1393  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4147  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.892231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2097  twin-arginine translocation pathway signal  25.53 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.380982  hitchhiker  0.00612544 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4516  extracellular solute-binding protein  22.75 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3529  extracellular solute-binding protein  21.72 
 
 		 458 aa  63.9  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00601615  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1243  extracellular solute-binding protein  21.59 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4328  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3960  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2928  extracellular solute-binding protein  20.45 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3554  putative ABC transporter periplasmic-binding protein  23.66 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1258  twin-arginine translocation pathway signal  26.22 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3873  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 		 463 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0964469  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 504 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4117  ABC transporter substrate-binding protein, periplasmic component  25.37 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.16072  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  32.12 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3322  twin-arginine translocation pathway signal  24.62 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.9 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  21.63 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0502  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 437 aa  56.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6130  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 		 448 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.307957  normal  0.305862 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0306  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 473 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2546  twin-arginine translocation pathway signal  24.18 
 
 		 461 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6542  extracellular solute-binding protein family 1  27.96 
 
 		 448 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 		 414 aa  54.3  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  23.71 
 
 		 411 aa  53.9  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.71 
 
 		 366 aa  53.5  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  22.78 
 
 		 459 aa  53.5  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5713  extracellular solute-binding protein family 1  29.31 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3669  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 492 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 452 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 		 421 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2910  twin-arginine translocation pathway signal  22.99 
 
 		 490 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0986419  normal  0.0603659 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0011  twin-arginine translocation pathway signal  21.41 
 
 		 464 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4863  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 492 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.426159 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 392 aa  51.6  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 392 aa  51.6  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  35.21 
 
 		 441 aa  51.2  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 413 aa  51.2  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 415 aa  50.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 450 aa  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5337  extracellular solute-binding protein family 1  29.31 
 
 		 434 aa  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0694  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 		 415 aa  49.7  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.333505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  29.22 
 
 		 456 aa  49.7  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.91 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03697  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 		 675 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  23.37 
 
 		 398 aa  49.7  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1283  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 450 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  unclonable  0.0000000346676  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  35.06 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  35.06 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.09 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 		 417 aa  49.3  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  33.77 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  33.77 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3646  twin-arginine translocation pathway signal  26.89 
 
 		 441 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.17089  normal  0.182494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  33.8 
 
 		 443 aa  48.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 		 438 aa  47.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 424 aa  47.4  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0597  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 500 aa  47  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  29.6 
 
 		 441 aa  47.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  22.65 
 
 		 480 aa  47  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  28.05 
 
 		 418 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1353  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 434 aa  47  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 406 aa  47  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 442 aa  47  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 		 427 aa  46.6  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.02 
 
 		 430 aa  46.6  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  20.49 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  23.41 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>