42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2928 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2928  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 458 aa  952    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6832  putative ABC transporter substrate-binding protein  72.33 
 
 		 460 aa  712    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0145789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3687  extracellular solute-binding protein family 1  65.2 
 
 		 461 aa  625  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1243  extracellular solute-binding protein  63.44 
 
 		 461 aa  609  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3529  extracellular solute-binding protein  65.12 
 
 		 458 aa  607  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00601615  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1393  extracellular solute-binding protein  62.36 
 
 		 461 aa  589  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0068  extracellular solute-binding protein family 1  32.57 
 
 		 486 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4188  extracellular solute-binding protein  32.8 
 
 		 465 aa  267  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1258  twin-arginine translocation pathway signal  25.86 
 
 		 442 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2892  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1413  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1619  extracellular solute-binding protein  20.45 
 
 		 450 aa  65.9  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3646  twin-arginine translocation pathway signal  23.39 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.17089  normal  0.182494 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4328  extracellular solute-binding protein  22.16 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5713  extracellular solute-binding protein family 1  21.98 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5337  extracellular solute-binding protein family 1  21.7 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0531  extracellular solute-binding protein family 1  22.37 
 
 		 437 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0502  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3322  twin-arginine translocation pathway signal  22.16 
 
 		 441 aa  57  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2097  twin-arginine translocation pathway signal  22.67 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.380982  hitchhiker  0.00612544 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 415 aa  56.6  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0822  extracellular solute-binding protein  21.68 
 
 		 436 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  21.08 
 
 		 438 aa  52.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3960  extracellular solute-binding protein family 1  21.86 
 
 		 441 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 425 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3554  putative ABC transporter periplasmic-binding protein  22.44 
 
 		 440 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  22.97 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2574  extracellular solute-binding protein family 1  29.93 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000602333  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.14 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.14 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  20.82 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 410 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 455 aa  43.9  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0253  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.42 
 
 		 424 aa  43.9  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 437 aa  43.9  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  25.86 
 
 		 437 aa  43.9  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  25.86 
 
 		 437 aa  43.9  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>