113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3554 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2097  twin-arginine translocation pathway signal  82.95 
 
 		 441 aa  761    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.380982  hitchhiker  0.00612544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3646  twin-arginine translocation pathway signal  74.77 
 
 		 441 aa  684    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.17089  normal  0.182494 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3322  twin-arginine translocation pathway signal  82.73 
 
 		 441 aa  759    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3554  putative ABC transporter periplasmic-binding protein  100 
 
 		 440 aa  909    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3960  extracellular solute-binding protein family 1  82.5 
 
 		 441 aa  780    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0822  extracellular solute-binding protein  59.64 
 
 		 436 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1413  extracellular solute-binding protein family 1  60.23 
 
 		 436 aa  551  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2892  extracellular solute-binding protein  62.75 
 
 		 436 aa  541  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0531  extracellular solute-binding protein family 1  56.81 
 
 		 437 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1258  twin-arginine translocation pathway signal  47.68 
 
 		 442 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4328  extracellular solute-binding protein  43.31 
 
 		 434 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5337  extracellular solute-binding protein family 1  42.26 
 
 		 434 aa  346  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5713  extracellular solute-binding protein family 1  41.91 
 
 		 434 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0502  extracellular solute-binding protein  39.73 
 
 		 437 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3119  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.34 
 
 		 442 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.657036  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3227  extracellular solute-binding protein family 1  26.34 
 
 		 442 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3313  extracellular solute-binding protein family 1  26.34 
 
 		 442 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778026  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1661  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 		 443 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0011  twin-arginine translocation pathway signal  23.37 
 
 		 464 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4117  ABC transporter substrate-binding protein, periplasmic component  24.59 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.16072  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2910  twin-arginine translocation pathway signal  24.77 
 
 		 490 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0986419  normal  0.0603659 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2546  twin-arginine translocation pathway signal  24.62 
 
 		 461 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.1 
 
 		 438 aa  79.7  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1206  twin-arginine translocation pathway signal  24.94 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.27 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6832  putative ABC transporter substrate-binding protein  22.66 
 
 		 460 aa  70.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0145789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4188  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 		 465 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  21.93 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  25.07 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3529  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00601615  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1619  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 450 aa  60.5  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1243  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 461 aa  59.7  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1393  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  22.82 
 
 		 421 aa  57  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  21.45 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3687  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  20.29 
 
 		 459 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  21.11 
 
 		 411 aa  53.9  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0068  extracellular solute-binding protein family 1  21.89 
 
 		 486 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.15 
 
 		 366 aa  52.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.05 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 		 414 aa  51.6  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  22.35 
 
 		 522 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  28.02 
 
 		 464 aa  51.6  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 446 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 423 aa  51.2  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 428 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 420 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 		 426 aa  50.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 		 504 aa  49.7  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  21.11 
 
 		 437 aa  49.7  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 455 aa  49.7  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 		 443 aa  50.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  22.27 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0475  extracellular solute-binding protein family 1  22.4 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  23.01 
 
 		 405 aa  49.7  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.53 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5365  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.559287 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 498 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4758  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18880  carbohydrate-binding protein  21.7 
 
 		 460 aa  48.5  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal  0.173455 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0791  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 439 aa  47.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  21.41 
 
 		 425 aa  47.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2928  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 		 458 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3669  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 492 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  23.03 
 
 		 450 aa  47.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 		 433 aa  47  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 441 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  21.86 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4863  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 492 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.426159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 485 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6665  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 428 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  21.8 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  24.87 
 
 		 407 aa  45.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  29.08 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5331  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  26.29 
 
 		 431 aa  44.3  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.998389  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6794  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 439 aa  44.7  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>