103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1413 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2892  extracellular solute-binding protein  78.39 
 
 		 436 aa  699    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0822  extracellular solute-binding protein  93.58 
 
 		 436 aa  848    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0531  extracellular solute-binding protein family 1  71.49 
 
 		 437 aa  651    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1413  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 436 aa  896    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3646  twin-arginine translocation pathway signal  62.13 
 
 		 441 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.17089  normal  0.182494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3960  extracellular solute-binding protein family 1  61.22 
 
 		 441 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3322  twin-arginine translocation pathway signal  60.87 
 
 		 441 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2097  twin-arginine translocation pathway signal  60.41 
 
 		 441 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.380982  hitchhiker  0.00612544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3554  putative ABC transporter periplasmic-binding protein  60.68 
 
 		 440 aa  545  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4328  extracellular solute-binding protein  45.6 
 
 		 434 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0502  extracellular solute-binding protein  44.72 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1258  twin-arginine translocation pathway signal  46.83 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5337  extracellular solute-binding protein family 1  44.39 
 
 		 434 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5713  extracellular solute-binding protein family 1  43.9 
 
 		 434 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3119  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.32 
 
 		 442 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.657036  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1661  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 		 443 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0068  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 486 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3227  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 		 442 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3313  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 		 442 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778026  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6832  putative ABC transporter substrate-binding protein  23.56 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0145789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2546  twin-arginine translocation pathway signal  26.87 
 
 		 461 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1206  twin-arginine translocation pathway signal  27.92 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0011  twin-arginine translocation pathway signal  23.33 
 
 		 464 aa  83.2  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2910  twin-arginine translocation pathway signal  25.75 
 
 		 490 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0986419  normal  0.0603659 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4188  extracellular solute-binding protein  22.45 
 
 		 465 aa  80.9  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4117  ABC transporter substrate-binding protein, periplasmic component  23.87 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.16072  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3529  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 458 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00601615  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1393  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 461 aa  69.7  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1243  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1619  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3687  extracellular solute-binding protein family 1  23.06 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 455 aa  62  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  21.85 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  21.85 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2928  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  20.7 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  20.86 
 
 		 438 aa  57  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.46 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2244  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 		 455 aa  55.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.846858 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 439 aa  55.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 498 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 443 aa  53.9  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  23.44 
 
 		 428 aa  53.9  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  28.26 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  24.43 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  22.26 
 
 		 447 aa  51.6  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 433 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  20.29 
 
 		 421 aa  51.2  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 464 aa  50.8  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 449 aa  50.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 426 aa  50.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6665  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 423 aa  50.1  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1812  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  22.95 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  22.73 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0572  extracellular solute-binding protein family 1  22.1 
 
 		 470 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  22.43 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 424 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 		 424 aa  48.5  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  22.43 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  21.69 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  22.27 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1520  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  22.62 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 		 522 aa  47.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 		 423 aa  47.4  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  22.67 
 
 		 437 aa  47.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2336  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 430 aa  47  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  21.01 
 
 		 410 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01287  predicted sugar transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  27.23 
 
 		 430 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  20.97 
 
 		 420 aa  46.6  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1425  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.23 
 
 		 430 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2315  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 430 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01298  hypothetical protein  27.23 
 
 		 430 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1179  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.06 
 
 		 423 aa  46.6  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0916647  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0230  putative transporter periplasmic binding protein  23.58 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1739  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.58 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  22.65 
 
 		 412 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  23.38 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  21.31 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1073  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.58 
 
 		 399 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0065  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.58 
 
 		 426 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0354  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.58 
 
 		 426 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.824168  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1650  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.58 
 
 		 426 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1232  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.58 
 
 		 426 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  22.65 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 452 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  21.52 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  26.48 
 
 		 443 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  21.63 
 
 		 418 aa  44.7  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 411 aa  45.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 428 aa  44.3  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  40.43 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5365  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 418 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.559287 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.57 
 
 		 422 aa  43.9  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  21.37 
 
 		 410 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 		 434 aa  43.9  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 419 aa  43.5  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>