39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4117 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2546  twin-arginine translocation pathway signal  77.53 
 
 		 461 aa  747    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4117  ABC transporter substrate-binding protein, periplasmic component  100 
 
 		 446 aa  920    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.16072  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2910  twin-arginine translocation pathway signal  77.58 
 
 		 490 aa  734    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0986419  normal  0.0603659 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3227  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3313  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3119  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.25 
 
 		 442 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.657036  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2892  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 436 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1206  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 446 aa  96.3  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0531  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 437 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1661  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 443 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3646  twin-arginine translocation pathway signal  25.45 
 
 		 441 aa  87  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.17089  normal  0.182494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3554  putative ABC transporter periplasmic-binding protein  25.84 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0011  twin-arginine translocation pathway signal  22.94 
 
 		 464 aa  80.1  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1413  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 		 436 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2097  twin-arginine translocation pathway signal  24.03 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.380982  hitchhiker  0.00612544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3322  twin-arginine translocation pathway signal  22.77 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3960  extracellular solute-binding protein family 1  22.78 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0822  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5337  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1258  twin-arginine translocation pathway signal  23.25 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4328  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 434 aa  67  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5713  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0068  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1619  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0502  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 439 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.2 
 
 		 438 aa  50.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  20.49 
 
 		 425 aa  50.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4188  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 		 465 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  27.86 
 
 		 439 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 420 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3529  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00601615  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  27.17 
 
 		 436 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 435 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.24 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>