76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3313 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1661  extracellular solute-binding protein  81 
 
 
443 aa  735    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407934  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3119  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  95.93 
 
 
442 aa  867    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.657036  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3227  extracellular solute-binding protein family 1  99.77 
 
 
442 aa  915    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3313  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
442 aa  917    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778026  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1206  twin-arginine translocation pathway signal  59.82 
 
 
446 aa  533  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0011  twin-arginine translocation pathway signal  60.55 
 
 
464 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0531  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 
437 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2546  twin-arginine translocation pathway signal  29.73 
 
 
461 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2892  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 
436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4328  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 
434 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0822  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 
436 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5337  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 
434 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3322  twin-arginine translocation pathway signal  25.54 
 
 
441 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3646  twin-arginine translocation pathway signal  25.75 
 
 
441 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.17089  normal  0.182494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3554  putative ABC transporter periplasmic-binding protein  26.34 
 
 
440 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3960  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 
441 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5713  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 
434 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4117  ABC transporter substrate-binding protein, periplasmic component  27.42 
 
 
446 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.16072  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0502  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 
437 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2097  twin-arginine translocation pathway signal  24.21 
 
 
441 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.380982  hitchhiker  0.00612544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2910  twin-arginine translocation pathway signal  27.85 
 
 
490 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0986419  normal  0.0603659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1413  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 
436 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1258  twin-arginine translocation pathway signal  24.21 
 
 
442 aa  93.6  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 
410 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  28.42 
 
 
410 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.87 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  31.35 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  31.35 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 
411 aa  65.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
399 aa  65.9  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.46 
 
 
366 aa  64.7  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  23.46 
 
 
411 aa  64.3  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1879  extracellular solute-binding protein  21.44 
 
 
453 aa  63.2  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  31.41 
 
 
414 aa  60.5  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.58 
 
 
438 aa  56.2  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 
436 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 
433 aa  55.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 
411 aa  54.7  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.69 
 
 
426 aa  53.5  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18880  carbohydrate-binding protein  32 
 
 
460 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal  0.173455 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 
455 aa  53.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 
423 aa  51.2  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  28.1 
 
 
446 aa  51.2  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 
437 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4693  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 
457 aa  50.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.363745 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3873  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 
463 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0964469  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  30.26 
 
 
422 aa  49.7  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 
435 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27350  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.05 
 
 
444 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.404715  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  30.26 
 
 
422 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  34.31 
 
 
422 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 
424 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 
421 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0175  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 
458 aa  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 
410 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0068  extracellular solute-binding protein family 1  20.83 
 
 
486 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 
435 aa  47.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 
498 aa  47.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 
401 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.32 
 
 
406 aa  47  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  20.48 
 
 
450 aa  46.6  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
418 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 
452 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 
425 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.14 
 
 
444 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 
411 aa  44.7  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  30.69 
 
 
408 aa  44.3  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 
444 aa  44.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.33 
 
 
430 aa  44.3  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 
522 aa  44.3  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 
419 aa  43.9  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 
439 aa  44.3  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2170  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 
428 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  19.47 
 
 
459 aa  43.9  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 
428 aa  43.5  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 
504 aa  43.5  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>