64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4188 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4188  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 465 aa  949    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0068  extracellular solute-binding protein family 1  47.35 
 
 		 486 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6832  putative ABC transporter substrate-binding protein  34.72 
 
 		 460 aa  295  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0145789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1393  extracellular solute-binding protein  32.56 
 
 		 461 aa  292  8e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3529  extracellular solute-binding protein  32.87 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00601615  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1243  extracellular solute-binding protein  32.41 
 
 		 461 aa  290  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3687  extracellular solute-binding protein family 1  32.41 
 
 		 461 aa  286  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2928  extracellular solute-binding protein  32.8 
 
 		 458 aa  259  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1619  extracellular solute-binding protein  22.01 
 
 		 450 aa  96.7  7e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0531  extracellular solute-binding protein family 1  21.72 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2892  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 436 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1413  extracellular solute-binding protein family 1  22.45 
 
 		 436 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0822  extracellular solute-binding protein  22.75 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.79 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2097  twin-arginine translocation pathway signal  23.68 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.380982  hitchhiker  0.00612544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3322  twin-arginine translocation pathway signal  23.06 
 
 		 441 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3960  extracellular solute-binding protein family 1  23.19 
 
 		 441 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3646  twin-arginine translocation pathway signal  22.53 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.17089  normal  0.182494 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5713  extracellular solute-binding protein family 1  22.29 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3554  putative ABC transporter periplasmic-binding protein  22.69 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  22.98 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1258  twin-arginine translocation pathway signal  24.04 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2546  twin-arginine translocation pathway signal  24.74 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5337  extracellular solute-binding protein family 1  21.97 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4328  extracellular solute-binding protein  22.75 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2910  twin-arginine translocation pathway signal  25.11 
 
 		 490 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0986419  normal  0.0603659 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0502  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 		 424 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2244  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 455 aa  54.3  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.846858 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  22.51 
 
 		 419 aa  53.5  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0034  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.73 
 
 		 438 aa  50.4  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2195  extracellular solute-binding protein family 1  21.99 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  22.15 
 
 		 399 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  26.12 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4117  ABC transporter substrate-binding protein, periplasmic component  23.16 
 
 		 446 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.16072  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  21.91 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 423 aa  48.5  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  21.22 
 
 		 420 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 		 410 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  21.6 
 
 		 419 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 421 aa  47  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  26.59 
 
 		 419 aa  47  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 411 aa  46.6  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.66 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0174  extracellular solute-binding protein family 1  28.92 
 
 		 951 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.01491  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0297  extracellular solute-binding protein family 1  22.37 
 
 		 453 aa  46.6  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0248346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  19.86 
 
 		 439 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1317  extracellular solute-binding protein  21.24 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  20.54 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  27.16 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  20.36 
 
 		 422 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 429 aa  44.3  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2338  maltose-binding periplasmic protein precursor  26.83 
 
 		 408 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2659  extracellular solute-binding protein family 1  23.62 
 
 		 431 aa  43.5  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00136924  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  20.36 
 
 		 422 aa  43.5  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  26.83 
 
 		 408 aa  43.5  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  20.36 
 
 		 422 aa  43.5  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  21.6 
 
 		 411 aa  43.1  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 		 401 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  20.88 
 
 		 406 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>