31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1206 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1206  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 446 aa  925    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0011  twin-arginine translocation pathway signal  65.85 
 
 		 464 aa  586  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1661  extracellular solute-binding protein  60.5 
 
 		 443 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3119  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  58.33 
 
 		 442 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.657036  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3313  extracellular solute-binding protein family 1  59.03 
 
 		 442 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3227  extracellular solute-binding protein family 1  59.03 
 
 		 442 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2546  twin-arginine translocation pathway signal  29.02 
 
 		 461 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4328  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 434 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5337  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 		 434 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2910  twin-arginine translocation pathway signal  26.79 
 
 		 490 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0986419  normal  0.0603659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0502  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 437 aa  94  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0531  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 		 437 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4117  ABC transporter substrate-binding protein, periplasmic component  25 
 
 		 446 aa  90.5  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.16072  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1258  twin-arginine translocation pathway signal  25.98 
 
 		 442 aa  89.7  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2892  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 436 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5713  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 		 434 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1413  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 		 436 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0822  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3646  twin-arginine translocation pathway signal  25.93 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.17089  normal  0.182494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3960  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3322  twin-arginine translocation pathway signal  25.25 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3554  putative ABC transporter periplasmic-binding protein  25.25 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2097  twin-arginine translocation pathway signal  25.08 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.380982  hitchhiker  0.00612544 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 423 aa  53.5  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 411 aa  50.1  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  22.51 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  22.19 
 
 		 366 aa  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0068  extracellular solute-binding protein family 1  20.63 
 
 		 486 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 411 aa  47  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1095  extracellular solute-binding protein family 1  23.19 
 
 		 530 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 399 aa  43.5  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>