64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1243 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6832  putative ABC transporter substrate-binding protein  68.72 
 
 		 460 aa  658    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0145789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3687  extracellular solute-binding protein family 1  83.95 
 
 		 461 aa  822    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1393  extracellular solute-binding protein  69.53 
 
 		 461 aa  668    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1243  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 461 aa  956    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3529  extracellular solute-binding protein  79.17 
 
 		 458 aa  736    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00601615  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2928  extracellular solute-binding protein  63.44 
 
 		 458 aa  595  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4188  extracellular solute-binding protein  32.41 
 
 		 465 aa  290  4e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0068  extracellular solute-binding protein family 1  33.19 
 
 		 486 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.62 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1258  twin-arginine translocation pathway signal  25.82 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1413  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0502  extracellular solute-binding protein  22.4 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1619  extracellular solute-binding protein  21.59 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5713  extracellular solute-binding protein family 1  22.65 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  22.16 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4328  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2892  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0822  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2097  twin-arginine translocation pathway signal  24.41 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.380982  hitchhiker  0.00612544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3646  twin-arginine translocation pathway signal  24 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.17089  normal  0.182494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3554  putative ABC transporter periplasmic-binding protein  24.53 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3960  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5337  extracellular solute-binding protein family 1  22.47 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3322  twin-arginine translocation pathway signal  23.62 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2588  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000485668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0531  extracellular solute-binding protein family 1  21.98 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  21.85 
 
 		 414 aa  55.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  19.68 
 
 		 414 aa  54.7  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  22.42 
 
 		 422 aa  52.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  22.42 
 
 		 422 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  21.82 
 
 		 504 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 422 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 415 aa  50.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.85 
 
 		 427 aa  50.1  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  22.06 
 
 		 422 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  22.16 
 
 		 399 aa  48.5  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  22.39 
 
 		 421 aa  47.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 420 aa  47.4  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 420 aa  47  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 414 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0126  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 		 477 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 415 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  23.38 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  28.32 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  22.98 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2052  extracellular solute-binding protein  22.75 
 
 		 438 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  21.36 
 
 		 423 aa  44.7  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  22.91 
 
 		 412 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 450 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0034  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.18 
 
 		 438 aa  44.3  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  22.78 
 
 		 425 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 421 aa  43.9  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3956  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.49 
 
 		 416 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  0.0187852 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 436 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 418 aa  43.5  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  24.49 
 
 		 421 aa  43.5  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 412 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  23.79 
 
 		 440 aa  43.1  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>