More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1866 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 434 aa  869    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  91.47 
 
 		 434 aa  777    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  72.91 
 
 		 435 aa  620  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  47.26 
 
 		 419 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  44.25 
 
 		 431 aa  361  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  42.41 
 
 		 427 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  36.25 
 
 		 495 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  33.42 
 
 		 428 aa  206  5e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  32.82 
 
 		 435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  32.43 
 
 		 431 aa  196  5.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  32.95 
 
 		 434 aa  196  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  32.55 
 
 		 424 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  32.9 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  33.24 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  31.97 
 
 		 432 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0185  extracellular solute-binding protein family 1  30.02 
 
 		 436 aa  176  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.515223  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  30.07 
 
 		 427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  31.3 
 
 		 429 aa  169  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  30.9 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 		 420 aa  154  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  28.97 
 
 		 435 aa  152  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  30.69 
 
 		 435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 441 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 451 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 		 441 aa  130  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.97 
 
 		 436 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  27.47 
 
 		 437 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2754  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 		 443 aa  123  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  31.99 
 
 		 442 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  29.41 
 
 		 442 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  31.91 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  30.34 
 
 		 441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.27 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  29.41 
 
 		 448 aa  113  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 		 431 aa  113  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 		 451 aa  113  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  27.85 
 
 		 439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  26.65 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  29.66 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.88 
 
 		 426 aa  107  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  26.52 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  26.52 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.59 
 
 		 438 aa  102  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 421 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 417 aa  99.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 408 aa  99.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 408 aa  99  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 417 aa  98.2  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 419 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  28.52 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 420 aa  97.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 420 aa  97.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 419 aa  97.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 419 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 419 aa  94.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 424 aa  94.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 414 aa  86.7  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.22 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3985  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 631 aa  72.4  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0580929  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  30.25 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  29.88 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 		 452 aa  67.4  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.85 
 
 		 434 aa  67  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.48 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  24.33 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4612  extracellular solute-binding protein family 1  31.95 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4454  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 466 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4871  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  32.45 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4425  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446855  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>