More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6524 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  96.7 
 
 		 424 aa  800    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 424 aa  863    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  54.19 
 
 		 430 aa  461  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  38.9 
 
 		 444 aa  279  7e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  36.87 
 
 		 442 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  36 
 
 		 434 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  33.61 
 
 		 437 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  30.68 
 
 		 446 aa  186  8e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  29.02 
 
 		 467 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  32.74 
 
 		 424 aa  162  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  30.05 
 
 		 410 aa  155  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  32.72 
 
 		 421 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  27.19 
 
 		 421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  31.69 
 
 		 421 aa  143  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  30.81 
 
 		 452 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  31.5 
 
 		 450 aa  138  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  30.07 
 
 		 452 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  28.5 
 
 		 456 aa  136  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 		 417 aa  130  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.94 
 
 		 449 aa  131  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  28.83 
 
 		 440 aa  121  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 		 449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.89 
 
 		 453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  29.43 
 
 		 445 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  27.49 
 
 		 418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 		 429 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 420 aa  109  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  25.24 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.36 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0917  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 455 aa  107  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.728334  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  27.48 
 
 		 457 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 445 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.31 
 
 		 458 aa  101  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 		 434 aa  99.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  25.92 
 
 		 424 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 438 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 434 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 		 422 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 434 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.54 
 
 		 450 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0411  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.439626  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.3 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4188  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 454 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 444 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 440 aa  83.2  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  27.8 
 
 		 504 aa  83.2  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 431 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.19 
 
 		 444 aa  79.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.5 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.32 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  24.25 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 462 aa  73.9  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  26.6 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.63 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.24 
 
 		 444 aa  73.2  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  27.48 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  28.66 
 
 		 446 aa  69.3  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 522 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0528  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  22.85 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  25.56 
 
 		 229 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0589  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 459 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1957  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000130159  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1068  sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  23.16 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.238718 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>