More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0528 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0528  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  100 
 
 
414 aa  851    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1068  sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  100 
 
 
390 aa  806    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.238718 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0589  extracellular solute-binding protein  99.76 
 
 
414 aa  850    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 
441 aa  87  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.59 
 
 
407 aa  82  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 
464 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0770  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 
444 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  25.4 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  25.4 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  26.61 
 
 
445 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 
424 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 
415 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.3 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2834  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 
459 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873121  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2274  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 
428 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 
433 aa  68.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  22.65 
 
 
424 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8464  extracellular solute-binding protein family 1  33.73 
 
 
481 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.635867  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2845  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 
439 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  32.92 
 
 
431 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  34.29 
 
 
457 aa  66.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  22.39 
 
 
429 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 
431 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 
441 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 
411 aa  64.7  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  32.07 
 
 
412 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 
437 aa  63.9  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5409  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.61 
 
 
457 aa  63.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3895  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 
433 aa  63.2  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  27.5 
 
 
417 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  31.15 
 
 
412 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7590  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  22.92 
 
 
447 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1732  extracellular solute-binding protein family 1  23.19 
 
 
415 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000368486  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 
410 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2114  extracellular solute-binding protein family 1  27.02 
 
 
428 aa  62  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  23.72 
 
 
446 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 
423 aa  60.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  31.78 
 
 
414 aa  60.5  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.34 
 
 
366 aa  60.5  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0910  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 
466 aa  60.5  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.764586  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.34 
 
 
411 aa  60.5  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  57.5 
 
 
416 aa  60.5  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 
410 aa  60.5  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 
436 aa  59.7  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 
411 aa  60.1  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  22.4 
 
 
423 aa  59.7  0.00000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03302  glycerol-3-phosphate transporter subunit  22.5 
 
 
438 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0262  extracellular solute-binding protein family 1  22.5 
 
 
438 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1264  glycerol-3-phosphate-binding periplasmic lipoprotein signal peptide  27.38 
 
 
438 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.400828  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2052  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 
438 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4767  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  22.5 
 
 
438 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.552805 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2526  extracellular solute-binding protein family 1  28.64 
 
 
520 aa  59.7  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430481  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03255  hypothetical protein  22.5 
 
 
438 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3650  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  22.5 
 
 
438 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  30.73 
 
 
425 aa  58.9  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0263  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  22.5 
 
 
438 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 
402 aa  59.3  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 
443 aa  59.7  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  22.82 
 
 
419 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0700  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  24.9 
 
 
458 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1092  extracellular solute-binding protein family 1  27.38 
 
 
438 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0503452  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 
460 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2659  extracellular solute-binding protein family 1  36.19 
 
 
431 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00136924  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3732  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  22.5 
 
 
438 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1185  extracellular solute-binding protein family 1  27.38 
 
 
438 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276437  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04930  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.71 
 
 
442 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3870  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  22.5 
 
 
438 aa  58.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3931  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  22.19 
 
 
438 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 
437 aa  58.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0483  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
458 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 
459 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4733  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  24.46 
 
 
458 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 
436 aa  58.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0538  glycerol-3-phosphate ABC transporter glycerol-3-phosphate-binding protein  24.9 
 
 
458 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  24.9 
 
 
458 aa  57.4  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0482  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  24.9 
 
 
458 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0569  glycerol-3-phosphate ABC transporter glycerol-3-phosphate-binding protein  24.9 
 
 
458 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  22.26 
 
 
436 aa  57  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.5 
 
 
406 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0606  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  24.9 
 
 
458 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0625  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  24.9 
 
 
458 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3962  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  21.58 
 
 
439 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0256  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  21.58 
 
 
439 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6664  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 
452 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  54 
 
 
416 aa  57  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3655  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  34.88 
 
 
439 aa  56.6  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0632  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein, putative  39.24 
 
 
458 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4693  extracellular solute-binding protein family 1  40.51 
 
 
457 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.363745 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0349  glycerol-3-phosphate ABC transporter, periplasmic glycerol-3-phosphate-binding protein  47.83 
 
 
441 aa  55.8  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 
421 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 
444 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3748  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  21.81 
 
 
438 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3306  extracellular solute-binding protein  34.29 
 
 
431 aa  55.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3856  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  20.18 
 
 
440 aa  55.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.64819 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3759  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  21.81 
 
 
438 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  22.49 
 
 
424 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5465  extracellular solute-binding protein  36.71 
 
 
434 aa  54.7  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.355429  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3869  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  21.81 
 
 
438 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>