96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0399 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 430 aa  873    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  58.39 
 
 		 433 aa  495  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  53.01 
 
 		 446 aa  432  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2837  extracellular solute-binding protein family 1  56.67 
 
 		 441 aa  421  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0236558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08420  carbohydrate-binding protein  50.68 
 
 		 438 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.837516  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  46.06 
 
 		 424 aa  345  1e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  38.44 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  40.89 
 
 		 434 aa  256  6e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  35.22 
 
 		 462 aa  247  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  36.52 
 
 		 438 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  40.29 
 
 		 435 aa  242  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  39.18 
 
 		 422 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  37.07 
 
 		 433 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  38.4 
 
 		 432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  37.66 
 
 		 428 aa  220  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  35.5 
 
 		 450 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2611  extracellular solute-binding protein family 1  35.96 
 
 		 450 aa  216  5e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606136  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  37.28 
 
 		 428 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  35.29 
 
 		 433 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  34.04 
 
 		 447 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  38.48 
 
 		 435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  34.48 
 
 		 434 aa  193  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  29.69 
 
 		 431 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 452 aa  116  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 452 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 		 417 aa  112  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 430 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  26.99 
 
 		 410 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.28 
 
 		 450 aa  104  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  24.2 
 
 		 418 aa  100  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.59 
 
 		 416 aa  100  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.63 
 
 		 449 aa  97.4  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  32.52 
 
 		 229 aa  95.1  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 		 440 aa  92  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  26.77 
 
 		 449 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 445 aa  88.2  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 420 aa  89  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 480 aa  87.8  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 		 439 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  26 
 
 		 437 aa  87  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.49 
 
 		 453 aa  85.9  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.69 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.84 
 
 		 458 aa  79.3  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 		 445 aa  73.2  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 456 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  26.43 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.6 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 421 aa  67  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 424 aa  66.2  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  25.52 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.73 
 
 		 431 aa  57  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  22.88 
 
 		 457 aa  57  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0411  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 449 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.439626  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 444 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  30.94 
 
 		 433 aa  50.8  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.25 
 
 		 444 aa  50.8  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2112  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 		 449 aa  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0884714  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4188  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 		 454 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  22.93 
 
 		 434 aa  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  28.68 
 
 		 430 aa  47  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 413 aa  47  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1904  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 		 429 aa  46.6  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172949  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.51 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  28.46 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  33.04 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  20.16 
 
 		 417 aa  45.8  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  22.46 
 
 		 436 aa  45.8  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  23.2 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  20.33 
 
 		 416 aa  45.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  21.89 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  22.14 
 
 		 441 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 		 430 aa  43.9  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 467 aa  43.1  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.99 
 
 		 463 aa  43.1  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 393 aa  43.1  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>