160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6282 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 433 aa  883    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  48.25 
 
 		 450 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  46.7 
 
 		 447 aa  385  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  44.64 
 
 		 435 aa  333  3e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  42.07 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  41.4 
 
 		 432 aa  324  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  39.17 
 
 		 432 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  40.51 
 
 		 428 aa  307  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  42.09 
 
 		 428 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  39.95 
 
 		 433 aa  289  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  40.62 
 
 		 422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  36.63 
 
 		 424 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  33 
 
 		 462 aa  243  6e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  34.69 
 
 		 438 aa  236  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  36.24 
 
 		 433 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  34.91 
 
 		 430 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  34 
 
 		 446 aa  207  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 435 aa  207  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08420  carbohydrate-binding protein  34.47 
 
 		 438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.837516  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  30.41 
 
 		 434 aa  194  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2837  extracellular solute-binding protein family 1  34.56 
 
 		 441 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0236558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2611  extracellular solute-binding protein family 1  30.92 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606136  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 431 aa  156  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 417 aa  138  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  28.18 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  30.16 
 
 		 452 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 420 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 		 418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  27.68 
 
 		 430 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 		 445 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  25.53 
 
 		 437 aa  103  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.74 
 
 		 416 aa  103  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  34.91 
 
 		 229 aa  97.1  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 		 434 aa  96.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 		 440 aa  89.7  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 442 aa  89.7  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 444 aa  89.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  26.17 
 
 		 437 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 449 aa  89.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  27.95 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 		 456 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.09 
 
 		 449 aa  82  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.16 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.79 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  22.15 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.3 
 
 		 447 aa  73.9  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  23.19 
 
 		 467 aa  70.5  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  27.49 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06942  hypothetical protein  32.7 
 
 		 157 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.21 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 424 aa  67  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 480 aa  66.2  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.3 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  23.79 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  23.2 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  22.78 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5048  extracellular solute-binding protein family 1  22.49 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 424 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 432 aa  59.7  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1957  extracellular solute-binding protein  23.19 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000130159  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  22.6 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27400  periplasmic mannitol-binding protein of mannitol ABC transporter  25.98 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  22.57 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2112  extracellular solute-binding protein family 1  20.47 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0884714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.06 
 
 		 431 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  24.51 
 
 		 467 aa  56.6  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.08 
 
 		 444 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 434 aa  53.9  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  23.57 
 
 		 430 aa  53.5  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1435  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.37 
 
 		 435 aa  53.1  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0110058  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2640  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4188  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.6 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  24.3 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 421 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  48.21 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2376  extracellular solute-binding protein family 1  21.74 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4181  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 435 aa  51.2  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000770865  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  23.13 
 
 		 430 aa  51.6  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>