165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1557 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 428 aa  870    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  91.82 
 
 		 428 aa  762    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  47.24 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  44.21 
 
 		 432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  43.21 
 
 		 432 aa  329  6e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  44.5 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  42.05 
 
 		 447 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  38.33 
 
 		 450 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  39.91 
 
 		 433 aa  292  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  39.02 
 
 		 424 aa  279  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  40.52 
 
 		 422 aa  272  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  39.76 
 
 		 433 aa  270  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  35.82 
 
 		 462 aa  249  8e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  37.57 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  36.11 
 
 		 434 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  34.88 
 
 		 433 aa  222  9e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  37.66 
 
 		 430 aa  220  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  32.87 
 
 		 435 aa  203  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08420  carbohydrate-binding protein  35.31 
 
 		 438 aa  195  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.837516  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  34.58 
 
 		 446 aa  190  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2837  extracellular solute-binding protein family 1  34.78 
 
 		 441 aa  189  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0236558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2611  extracellular solute-binding protein family 1  31.82 
 
 		 450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606136  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 417 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 		 452 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  33.55 
 
 		 452 aa  130  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.91 
 
 		 416 aa  127  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 		 410 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 		 430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 418 aa  113  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 		 434 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 420 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.06 
 
 		 447 aa  99.8  8e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 		 442 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  26.86 
 
 		 445 aa  90.1  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  30.46 
 
 		 229 aa  87.4  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.61 
 
 		 450 aa  84.7  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 		 480 aa  78.6  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  25.31 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  27.09 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06942  hypothetical protein  35.06 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 444 aa  76.3  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 		 438 aa  75.9  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 449 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  23.61 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.57 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.86 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  24.51 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 421 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2112  extracellular solute-binding protein family 1  20.71 
 
 		 449 aa  67  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0884714  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.23 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1435  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.91 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0110058  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  26.21 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.35 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  24.3 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  27.38 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 444 aa  59.7  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  22.03 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  22.52 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2466  extracellular solute-binding protein  20.77 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000586108  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 446 aa  56.2  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  24.68 
 
 		 440 aa  53.9  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 439 aa  53.9  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.89 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  21.67 
 
 		 467 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  31.94 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4472  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.95 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0411  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 449 aa  50.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.439626  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0306  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.34 
 
 		 403 aa  50.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3914  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.34 
 
 		 403 aa  50.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0378  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.34 
 
 		 403 aa  50.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 513 aa  50.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1957  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000130159  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.51 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 454 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  22.85 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>