More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2845 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 424 aa  874    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 420 aa  210  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  31.01 
 
 		 410 aa  209  6e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  29.74 
 
 		 417 aa  182  9.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  27.5 
 
 		 418 aa  157  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 		 442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  29.7 
 
 		 437 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 424 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 444 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  31.02 
 
 		 229 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 424 aa  99.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  22.87 
 
 		 432 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 457 aa  95.5  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0284  extracellular solute-binding protein family 1  31.48 
 
 		 414 aa  94.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 402 aa  94.7  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 446 aa  94.4  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 424 aa  93.6  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1957  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 446 aa  93.2  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000130159  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 		 467 aa  93.2  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  22.37 
 
 		 434 aa  92.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 431 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06942  hypothetical protein  40.51 
 
 		 157 aa  91.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 424 aa  90.5  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 435 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 434 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 422 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 421 aa  87.4  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 421 aa  87  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 		 429 aa  86.7  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 424 aa  86.3  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 		 446 aa  86.3  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  27.02 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  25.13 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  23.51 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0917  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.728334  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 438 aa  82.8  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.53 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.84 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  23.26 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  22.96 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  24.77 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 		 462 aa  79.7  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.68 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.27 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 480 aa  76.6  0.0000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  23.61 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 427 aa  76.3  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.29 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0270  extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.562219  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2837  extracellular solute-binding protein family 1  22.87 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0236558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  23.83 
 
 		 437 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2112  extracellular solute-binding protein family 1  22.89 
 
 		 449 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0884714  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3591  extracellular solute-binding protein  21.94 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  22.83 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2378  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612639  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  23.37 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  25 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  22.06 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  22.06 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  22.06 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>