97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1882 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 446 aa  904    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08420  carbohydrate-binding protein  59.46 
 
 		 438 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.837516  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  53.69 
 
 		 433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2837  extracellular solute-binding protein family 1  56.35 
 
 		 441 aa  442  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0236558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  52.51 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  42.6 
 
 		 424 aa  305  8.000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  38.67 
 
 		 462 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  41.25 
 
 		 434 aa  241  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  36.57 
 
 		 432 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  34.16 
 
 		 438 aa  223  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2611  extracellular solute-binding protein family 1  34.86 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606136  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  37.97 
 
 		 432 aa  216  8e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  34.75 
 
 		 433 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  36.14 
 
 		 422 aa  202  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  34.95 
 
 		 435 aa  196  8.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  33.18 
 
 		 450 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  34.53 
 
 		 435 aa  189  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  34.47 
 
 		 428 aa  176  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  34.22 
 
 		 428 aa  171  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  31.68 
 
 		 447 aa  160  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  32.06 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  30.16 
 
 		 434 aa  153  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  30.03 
 
 		 431 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 452 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 430 aa  97.8  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.46 
 
 		 416 aa  92.8  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 417 aa  90.5  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 445 aa  89  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  26.43 
 
 		 437 aa  83.2  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.17 
 
 		 453 aa  76.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 438 aa  75.1  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  32.34 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.89 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  20.89 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 		 449 aa  71.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  25.38 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.44 
 
 		 449 aa  67.8  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 467 aa  63.2  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.97 
 
 		 458 aa  62  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.6 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  21.14 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  24.36 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.98 
 
 		 444 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.16 
 
 		 447 aa  55.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 444 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 438 aa  55.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.52 
 
 		 445 aa  53.5  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  29.33 
 
 		 446 aa  53.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  21.83 
 
 		 446 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  26.97 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2112  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 449 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0884714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 		 422 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 411 aa  49.3  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  24.9 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  24.85 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 421 aa  47.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  28.32 
 
 		 424 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 459 aa  47  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 411 aa  46.6  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  21.28 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1904  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172949  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 414 aa  44.7  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 		 421 aa  44.7  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 433 aa  44.3  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  21.07 
 
 		 411 aa  44.3  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06942  hypothetical protein  29.79 
 
 		 157 aa  43.9  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4181  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 435 aa  43.9  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000770865  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 429 aa  43.5  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2901  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 425 aa  43.5  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 437 aa  43.5  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 421 aa  43.5  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 415 aa  43.5  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>