More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2901 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  85.48 
 
 
513 aa  734    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2901  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
425 aa  869    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  59.03 
 
 
439 aa  508  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  48.64 
 
 
419 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  48.64 
 
 
419 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  31.96 
 
 
433 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 
428 aa  126  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 
428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 
438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2286  extracellular solute-binding protein family 1  29.53 
 
 
484 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.322369 
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.79 
 
 
439 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 
439 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.56 
 
 
439 aa  103  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7822  putative ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.27 
 
 
486 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 
424 aa  97.4  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 
414 aa  95.1  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 
411 aa  92.8  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 
411 aa  92.8  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 
428 aa  90.9  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 
466 aa  90.5  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  28.9 
 
 
436 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
423 aa  88.2  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  28.68 
 
 
439 aa  87.4  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3399  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 
440 aa  87  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  0.750741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2753  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 
410 aa  86.7  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 
441 aa  86.3  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2456  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 
451 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.674954  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 
450 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 
436 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5309  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 
447 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574903  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2278  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 
448 aa  84  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0974  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 
435 aa  82.8  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606433  normal  0.163223 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
435 aa  81.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 
419 aa  80.1  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.18 
 
 
443 aa  79.7  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4845  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 
434 aa  79.7  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834917  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 
431 aa  79.7  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
436 aa  78.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 
421 aa  79  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  22.47 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  25.12 
 
 
422 aa  78.2  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2610  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 
477 aa  77.4  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 
420 aa  77.8  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 
421 aa  77.4  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  25.32 
 
 
422 aa  77.8  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 
413 aa  77  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  23.2 
 
 
412 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 
437 aa  76.6  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 
422 aa  76.6  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  22.93 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 
446 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 
437 aa  75.1  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.18 
 
 
496 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  23.39 
 
 
447 aa  75.5  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 
436 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 
421 aa  75.5  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3777  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 
436 aa  75.5  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.253936  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 
453 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 
423 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 
412 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 
464 aa  74.7  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0646  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  31.09 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0353327  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 
424 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.86 
 
 
452 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 
522 aa  73.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.62 
 
 
424 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2796  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 
468 aa  73.6  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 
411 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2426  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9075  hypothetical protein  32.69 
 
 
558 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2064  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
449 aa  72.4  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 
455 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0138  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 
434 aa  71.2  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2902  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 
439 aa  71.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 
419 aa  71.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1108  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 
436 aa  71.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 
430 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  22.29 
 
 
484 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  21.52 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  30.41 
 
 
436 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  25.68 
 
 
436 aa  69.7  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0333  maltose/mannitol ABC transporter, periplasmic maltose/mannitol-binding protein, putative  26.53 
 
 
442 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00410857  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1034  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 
442 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4325  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 
454 aa  69.7  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0876  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.53 
 
 
442 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0755942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0079  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.53 
 
 
442 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 
412 aa  69.7  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0631  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.53 
 
 
442 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0872  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.53 
 
 
442 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2465  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.53 
 
 
442 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0699  extracellular solute-binding protein  22.82 
 
 
443 aa  69.7  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 
439 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 
439 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  21.67 
 
 
425 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0702  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 
440 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.812706  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
441 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>