More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0411 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0411  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 449 aa  913    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.439626  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  31.75 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  28.2 
 
 		 442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 434 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.69 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 		 410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 		 424 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  25.65 
 
 		 424 aa  91.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  25.26 
 
 		 437 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 444 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  28.47 
 
 		 449 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 		 421 aa  87  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.61 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 433 aa  79.7  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  26.37 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 		 444 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.26 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0297  extracellular solute-binding protein family 1  26.34 
 
 		 453 aa  73.2  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0248346 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0475  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  31.1 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.74 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.47 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.93 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 462 aa  69.3  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  29.74 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0791  extracellular solute-binding protein family 1  22.55 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  22.43 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  30.55 
 
 		 458 aa  67  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 435 aa  67  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0894  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 470 aa  67  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.444762  normal  0.144357 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 448 aa  66.6  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  26.61 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 450 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  27.18 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  26.14 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18880  carbohydrate-binding protein  24.23 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal  0.173455 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.5 
 
 		 458 aa  64.7  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  25.83 
 
 		 432 aa  63.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.93 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  22.68 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  21.45 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.28 
 
 		 449 aa  61.2  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.55 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  23.9 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  21.86 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.35 
 
 		 425 aa  59.7  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5309  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574903  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  23.91 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  25.6 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.6 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>