243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0747 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0747  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 435 aa  865    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118998 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4429  extracellular solute-binding protein  82.86 
 
 		 430 aa  676    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3624  extracellular solute-binding protein family 1  45.08 
 
 		 425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4463  extracellular solute-binding protein  37.88 
 
 		 411 aa  229  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00452134  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  29.79 
 
 		 411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.99 
 
 		 400 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  26.48 
 
 		 400 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 		 398 aa  91.3  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 391 aa  91.3  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 391 aa  87.8  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 395 aa  86.7  8e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4563  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 439 aa  86.7  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  23.02 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  20.16 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 456 aa  81.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0178  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  22.36 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  22.12 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 411 aa  76.3  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  18.95 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  29.84 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  21.98 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0406  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00219397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.15 
 
 		 431 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  20.85 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  21 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3827  extracellular solute-binding protein family 1  21.49 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2034  extracellular solute-binding protein family 1  21.46 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  0.822994 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  23.41 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0632  extracellular solute-binding protein family 1  23.14 
 
 		 434 aa  67  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.708501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2009  extracellular solute-binding protein family 1  21.11 
 
 		 422 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  21.69 
 
 		 457 aa  67  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2680  extracellular solute-binding protein family 1  27.69 
 
 		 458 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 424 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2714  extracellular solute-binding protein  22.51 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4119  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  24.12 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000674051  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  21.49 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  22.06 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4064  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein, putative  24.12 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0421403  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  22.77 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4138  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  23.79 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00348898  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3841  extracellular solute-binding protein  22.36 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000013033  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  21.36 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3754  maltose-maltodextrin ABC-related solute binding protein  23.79 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000542287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3770  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  23.79 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000087749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3922  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  23.79 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0134813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4229  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  23.79 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4032  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  23.79 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.83 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03790  maltose-binding periplasmic protein  23.32 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0386362 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  20.4 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  23.54 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2574  extracellular solute-binding protein family 1  19.7 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000602333  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  22.29 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.3 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  22.08 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  21.43 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1500  extracellular solute-binding protein  22.85 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  29.01 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  21.5 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3077  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2174  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.128166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0206  extracellular solute-binding protein family 1  23.24 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  25.96 
 
 		 434 aa  57  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 458 aa  57  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 		 417 aa  57  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2535  extracellular solute-binding protein family 1  22.64 
 
 		 418 aa  57  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.105932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.66 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  21.9 
 
 		 440 aa  56.2  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  22.33 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1617  extracellular solute-binding protein  21.36 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1865  extracellular solute-binding protein  20.85 
 
 		 454 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2649  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  22.15 
 
 		 450 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  21.92 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0832  multiple sugar transport system substrate-binding protein  23.06 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.669088  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3451  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.772574  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>