184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4429 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0747  extracellular solute-binding protein  82.86 
 
 		 435 aa  693    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118998 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4429  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 430 aa  855    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3624  extracellular solute-binding protein family 1  43.59 
 
 		 425 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4463  extracellular solute-binding protein  36.86 
 
 		 411 aa  210  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00452134  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  28.08 
 
 		 411 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 		 400 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  25.49 
 
 		 400 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.79 
 
 		 400 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  21.52 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4563  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0178  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  21.45 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  21.82 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.62 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  22.77 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  22.79 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  22.5 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  21.7 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  22.45 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  21.82 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0632  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.708501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  22.7 
 
 		 411 aa  63.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  20.96 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  21.77 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0406  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00219397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.8 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  21.78 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2680  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 		 458 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  22.13 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2009  extracellular solute-binding protein family 1  20.27 
 
 		 422 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2535  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.105932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3827  extracellular solute-binding protein family 1  21.76 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2034  extracellular solute-binding protein family 1  20.63 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  0.822994 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.1 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4119  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  21.29 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000674051  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2714  extracellular solute-binding protein  21.43 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182746  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  20.67 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  19.48 
 
 		 413 aa  57  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3922  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  21.29 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0134813  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3770  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  21.29 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000087749  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4229  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  21.29 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4032  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  21.29 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3754  maltose-maltodextrin ABC-related solute binding protein  21.29 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000542287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4064  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein, putative  20.97 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0421403  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  20.16 
 
 		 440 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3841  extracellular solute-binding protein  21.29 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000013033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4138  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  21.61 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00348898  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  22.98 
 
 		 427 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2574  extracellular solute-binding protein family 1  20.11 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000602333  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  22.55 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 		 405 aa  55.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03790  maltose-binding periplasmic protein  22.58 
 
 		 467 aa  55.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0386362 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  22.98 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 		 420 aa  54.3  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  22.08 
 
 		 411 aa  54.3  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 		 420 aa  54.3  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3451  extracellular solute-binding protein  21.59 
 
 		 418 aa  53.9  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.772574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  21.26 
 
 		 427 aa  53.9  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  21.58 
 
 		 457 aa  53.9  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 393 aa  53.9  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  22.08 
 
 		 411 aa  53.9  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 		 425 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 418 aa  53.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2057  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112802  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 437 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1617  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 460 aa  52  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1865  extracellular solute-binding protein  20.85 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 429 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  22.56 
 
 		 437 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 417 aa  50.8  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3387  extracellular solute-binding protein  21.7 
 
 		 447 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2649  extracellular solute-binding protein family 1  23.05 
 
 		 400 aa  50.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0306  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.25 
 
 		 403 aa  50.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>