More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1798 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  74.65 
 
 		 428 aa  677    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1904  extracellular solute-binding protein family 1  80.47 
 
 		 429 aa  731    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172949  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  80.93 
 
 		 429 aa  734    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1798  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 430 aa  893    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1688  oligogalacturonide ABC transporter, periplasmic oligogalacturonide-binding protein  100 
 
 		 430 aa  893    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0550228  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  80.7 
 
 		 430 aa  738    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  81.16 
 
 		 430 aa  741    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2648  oligogalacturonide ABC transporter periplasmic oligogalacturonide-binding protein  99.77 
 
 		 430 aa  890    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316005  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0777  extracellular solute-binding protein  59.53 
 
 		 428 aa  526  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  54.78 
 
 		 430 aa  494  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0825  extracellular solute-binding protein family 1  51.58 
 
 		 429 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2102  extracellular solute-binding protein family 1  49.76 
 
 		 439 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2395  extracellular solute-binding protein family 1  48.81 
 
 		 451 aa  422  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  39.01 
 
 		 433 aa  305  9.000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  38.29 
 
 		 434 aa  300  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  36.21 
 
 		 434 aa  282  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  36.45 
 
 		 430 aa  270  5e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  36.61 
 
 		 433 aa  266  5.999999999999999e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2376  extracellular solute-binding protein family 1  30.24 
 
 		 438 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2460  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 441 aa  153  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.372805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  27.68 
 
 		 424 aa  143  7e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0619  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 463 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000037115  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 428 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 		 439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 428 aa  120  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 		 432 aa  118  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 450 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1702  sugar-binding protein  24.54 
 
 		 442 aa  117  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.981171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 		 441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3402  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 		 451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000236647  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0806  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 437 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1049  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 		 437 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 432 aa  113  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 431 aa  112  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3578  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 428 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 422 aa  112  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2081  extracellular solute-binding protein family 1  23.54 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159947  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.3 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.3 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5580  ABC transporter/Periplasmic pectin oligomer binding protein  24.16 
 
 		 427 aa  103  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4335  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 428 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3324  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 427 aa  101  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000420771  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4006  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 428 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 436 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0970  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 428 aa  99.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0793  extracellular solute-binding protein family 1  24.39 
 
 		 442 aa  97.1  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  21.93 
 
 		 428 aa  96.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 446 aa  96.7  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4015  extracellular solute-binding protein family 1  23.31 
 
 		 428 aa  96.3  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.946152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.73 
 
 		 450 aa  95.9  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  22.51 
 
 		 429 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.48 
 
 		 438 aa  92  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3899  extracellular solute-binding protein family 1  22.65 
 
 		 435 aa  90.1  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1534  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 436 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  decreased coverage  0.00957964 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 434 aa  89  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  22.87 
 
 		 450 aa  87.4  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29740  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.32 
 
 		 437 aa  86.3  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  21.98 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  30.63 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 424 aa  79.7  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0589  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 		 452 aa  74.7  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289831  normal  0.0417818 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  20.51 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  32.87 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2228  extracellular solute-binding protein family 1  21.87 
 
 		 460 aa  70.1  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.754729 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.03 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2144  extracellular solute-binding protein family 1  28.19 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.41 
 
 		 410 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  28.37 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.98 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.57 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  22.45 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  31.41 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  32.12 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  31.17 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3557  extracellular solute-binding protein family 1  22.65 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 		 433 aa  63.2  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  31.15 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  36.44 
 
 		 488 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  31.39 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  34.75 
 
 		 488 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>