More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0192 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0192  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 444 aa  889    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.25123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4984  extracellular solute-binding protein family 1  38.99 
 
 		 432 aa  320  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000108283  decreased coverage  0.000897425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  36.2 
 
 		 415 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  29.22 
 
 		 411 aa  196  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  29.05 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.44 
 
 		 427 aa  98.2  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 429 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 432 aa  93.6  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 		 488 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 488 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0274  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 439 aa  87  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.285114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 431 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  27.86 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.38 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0263  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 439 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.962251  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.5 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.07 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  21.74 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.31 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3000  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  21.65 
 
 		 483 aa  67  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  22.78 
 
 		 442 aa  67  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  21.43 
 
 		 503 aa  66.6  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.56 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12341  periplasmic sugar-binding lipoprotein uspC  22.94 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  25.79 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  27.14 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  22.33 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  21.88 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3619  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 488 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  21.98 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00790  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.42 
 
 		 437 aa  62.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312494  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0516  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 488 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1702  sugar-binding protein  27.27 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.981171  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1049  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0297  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0248346 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0589  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 		 452 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289831  normal  0.0417818 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1468  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.9 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7341  sugar ABC transporter sugar-binding protein  21.75 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  20.74 
 
 		 460 aa  59.7  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2228  extracellular solute-binding protein family 1  28.64 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.754729 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.52 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  28.49 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2474  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000108946  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.81 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.72 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  20.35 
 
 		 449 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.86 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0270  extracellular solute-binding protein  22.19 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.562219  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  31.95 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  19.3 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.35 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  19.3 
 
 		 416 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 		 417 aa  57  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  20.8 
 
 		 421 aa  57  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  22.09 
 
 		 419 aa  57  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  29.07 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2114  extracellular solute-binding protein family 1  28.68 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  32.39 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 445 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0255  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 		 439 aa  55.8  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  24.39 
 
 		 487 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0806  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 		 437 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  22.11 
 
 		 504 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  25.35 
 
 		 432 aa  55.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01900  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.88 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.867357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>