47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3688 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3688  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 466 aa  933    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 443 aa  139  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 427 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 441 aa  123  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.29 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  21.9 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.83 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  21.23 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  23.18 
 
 		 408 aa  53.5  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  22.2 
 
 		 419 aa  53.1  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  22.13 
 
 		 432 aa  53.1  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  24.57 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0631  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 435 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  27.66 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 420 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0845  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 		 435 aa  51.2  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 436 aa  50.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  21.45 
 
 		 503 aa  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1895  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  21.75 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 483 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  22.26 
 
 		 488 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 464 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  21.72 
 
 		 488 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 		 441 aa  47.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  20.59 
 
 		 435 aa  47  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2920  extracellular solute-binding protein family 1  22.3 
 
 		 424 aa  47  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  20.33 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  22.78 
 
 		 442 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.56 
 
 		 407 aa  46.6  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3895  extracellular solute-binding protein  20.96 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  19.33 
 
 		 416 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.67 
 
 		 426 aa  45.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 433 aa  45.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  19.33 
 
 		 416 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  20.77 
 
 		 414 aa  44.3  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  21.59 
 
 		 434 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 		 424 aa  43.5  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 464 aa  43.5  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2313  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 901 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  23.99 
 
 		 411 aa  43.1  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>