243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4399 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_4399  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 455 aa  924    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0609802  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  28.86 
 
 		 431 aa  172  7.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  27.95 
 
 		 419 aa  169  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 439 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 439 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.47 
 
 		 496 aa  156  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 412 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 446 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 412 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 411 aa  101  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  26.97 
 
 		 447 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  22.3 
 
 		 414 aa  99.8  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  21.71 
 
 		 433 aa  98.2  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3777  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 436 aa  97.4  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.253936  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 411 aa  97.4  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  20.99 
 
 		 428 aa  96.7  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  25.34 
 
 		 421 aa  91.7  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 441 aa  90.1  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 444 aa  88.6  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 436 aa  88.6  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0431  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  23.03 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2064  extracellular solute-binding protein  22.72 
 
 		 449 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  21.17 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  20.32 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  22.73 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  22.52 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  22.94 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 		 436 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27400  periplasmic mannitol-binding protein of mannitol ABC transporter  21.5 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  23.72 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  22.37 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 437 aa  76.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  21.88 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1108  extracellular solute-binding protein family 1  22.73 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  21.93 
 
 		 455 aa  74.3  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  21.64 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0303  extracellular solute-binding protein family 1  21.79 
 
 		 478 aa  72.8  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0138  extracellular solute-binding protein  22.4 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  20.42 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  21.29 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3171  extracellular solute-binding protein  22.05 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  21.15 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  21.25 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3854  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  20.22 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0974  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606433  normal  0.163223 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4181  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000770865  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  21.61 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  22.74 
 
 		 422 aa  67  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0364  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  20.53 
 
 		 438 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  21.96 
 
 		 435 aa  67  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  21.08 
 
 		 424 aa  67  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0640  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 453 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.79 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4325  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 		 454 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  21.72 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0490  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000283806  hitchhiker  0.00214005 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  20.29 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2902  extracellular solute-binding protein  23 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  23 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  22.35 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  20.4 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2440  extracellular solute-binding protein  19.78 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0811647  decreased coverage  0.000336324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1094  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  0.028756 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0361  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  20.99 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  21.2 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  22.55 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4812  extracellular solute-binding protein  20.13 
 
 		 438 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  21.45 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  21.45 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  21.45 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  20.27 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  21.16 
 
 		 444 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  19.64 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.83 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2753  extracellular solute-binding protein family 1  20.88 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0889  extracellular solute-binding protein  22.25 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  22.5 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  22 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4845  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  26.1 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  20.81 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  21.52 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>