265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2819 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2819  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 461 aa  933    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3387  extracellular solute-binding protein  48.18 
 
 		 447 aa  427  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1773  extracellular solute-binding protein family 1  47.31 
 
 		 465 aa  417  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.504545  normal  0.290135 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  47.7 
 
 		 448 aa  408  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  43.24 
 
 		 434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1639  extracellular solute-binding protein family 1  39.78 
 
 		 463 aa  336  7e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.102178  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  41.63 
 
 		 464 aa  332  7.000000000000001e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01900  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  40.61 
 
 		 442 aa  288  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.867357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  30.75 
 
 		 460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  28.71 
 
 		 427 aa  156  8e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 		 420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 		 421 aa  129  8.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  25.51 
 
 		 416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25 
 
 		 416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 		 453 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28390  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.19 
 
 		 453 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12341  periplasmic sugar-binding lipoprotein uspC  25.83 
 
 		 440 aa  104  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 393 aa  88.6  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 		 454 aa  87.4  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  23.96 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.87 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  22.01 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.68 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  23.54 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  25 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11510  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.73 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  25.28 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.71 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 479 aa  72.4  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.34 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 447 aa  69.7  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.99 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.29 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  23.25 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3566  extracellular solute-binding protein family 1  21.87 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  22.09 
 
 		 483 aa  66.6  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  22.97 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.53 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  22.05 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  23.96 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.82 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  21.13 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  22.93 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.71 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 		 427 aa  59.7  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4693  extracellular solute-binding protein family 1  31.21 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.363745 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2115  extracellular solute-binding protein family 1  21.02 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.845793  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  20.29 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  21.32 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  22.45 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  21.88 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  22.52 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15060  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.11 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.138683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  27.52 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  28.73 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  22.42 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 422 aa  57  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  21.12 
 
 		 437 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  22.22 
 
 		 411 aa  57  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 		 431 aa  57  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 		 449 aa  57  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 437 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  19.45 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 		 421 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 421 aa  55.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  22.78 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.68 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  22.54 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2545  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 		 442 aa  55.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.43 
 
 		 437 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.43 
 
 		 437 aa  55.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>