126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1595 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1585  extracellular solute-binding protein family 1  78.44 
 
 
442 aa  703    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1595  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
440 aa  893    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.780174  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0181  extracellular solute-binding protein family 1  27.89 
 
 
595 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000497192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1046  extracellular solute-binding protein  30.69 
 
 
446 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  26.68 
 
 
454 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  28.31 
 
 
447 aa  98.2  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
427 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.62 
 
 
443 aa  81.3  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 
460 aa  77  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 
406 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  25.76 
 
 
408 aa  72.4  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  25.69 
 
 
411 aa  72  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 
442 aa  68.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 
417 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  26 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2265  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 
482 aa  65.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000515551  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 
420 aa  64.7  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 
408 aa  64.7  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 
422 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 
415 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 
443 aa  63.5  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0512  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 
423 aa  63.2  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00024476  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2474  extracellular solute-binding protein family 1  22.68 
 
 
484 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000108946  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.56 
 
 
426 aa  60.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.51 
 
 
431 aa  60.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.74 
 
 
419 aa  60.5  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 
420 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 
393 aa  58.9  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  22.35 
 
 
434 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 
441 aa  58.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 
429 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 
443 aa  57  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  31.82 
 
 
413 aa  56.6  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.61 
 
 
427 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 
453 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  28.23 
 
 
422 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  22.42 
 
 
443 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 
488 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  21.47 
 
 
483 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.87 
 
 
452 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 
414 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 
452 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 
421 aa  54.3  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 
510 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  29.38 
 
 
431 aa  54.3  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 
425 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  23.73 
 
 
441 aa  53.9  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 
406 aa  53.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 
488 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  20.53 
 
 
391 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 
443 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 
431 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 
404 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  29.48 
 
 
415 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 
449 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 
503 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  22.73 
 
 
421 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  22.73 
 
 
420 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  20.53 
 
 
391 aa  51.2  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  24.33 
 
 
404 aa  50.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 
449 aa  50.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 
455 aa  50.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 
414 aa  49.7  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  22.3 
 
 
425 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  19.93 
 
 
406 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  22.98 
 
 
480 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 
461 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.48 
 
 
435 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 
445 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  29.25 
 
 
431 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.87 
 
 
430 aa  48.9  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  21.51 
 
 
411 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  20.55 
 
 
418 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 
445 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  31.97 
 
 
455 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  31.97 
 
 
455 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  22.26 
 
 
403 aa  47.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1269  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 
412 aa  47.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  28.37 
 
 
436 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 
422 aa  47.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28390  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.99 
 
 
453 aa  47.4  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 
435 aa  47.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
419 aa  47  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  21.72 
 
 
392 aa  47.4  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  31.43 
 
 
449 aa  47  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 
447 aa  47.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  21.72 
 
 
392 aa  47.4  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3793  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 
459 aa  47  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46649  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 
411 aa  47  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 
456 aa  47  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  32.17 
 
 
441 aa  46.6  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3143  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 
473 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536467  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  25.1 
 
 
432 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 
433 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 
421 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 
425 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  23.73 
 
 
441 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1500  extracellular solute-binding protein  21.9 
 
 
393 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 
419 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>