211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5852 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5852  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
438 aa  842    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.26 
 
 
431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  27.98 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.32 
 
 
426 aa  106  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 
435 aa  103  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 
428 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 
433 aa  93.6  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 
433 aa  93.2  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  21.9 
 
 
429 aa  90.1  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 
400 aa  85.9  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 
427 aa  83.2  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 
424 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  21.5 
 
 
424 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 
411 aa  77  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 
430 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 
401 aa  77  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 
415 aa  76.6  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 
453 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4138  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  24.4 
 
 
419 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00348898  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 
424 aa  73.6  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  27.09 
 
 
434 aa  72.8  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3754  maltose-maltodextrin ABC-related solute binding protein  24.4 
 
 
419 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000542287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3770  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  24.77 
 
 
419 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000087749  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4064  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein, putative  24.1 
 
 
419 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0421403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3922  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  24.77 
 
 
419 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0134813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4229  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  24.77 
 
 
419 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4032  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  24.77 
 
 
419 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2649  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 
410 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4119  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  26.1 
 
 
419 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000674051  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  22.4 
 
 
432 aa  70.9  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 
392 aa  69.7  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 
440 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 
439 aa  67.4  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  22.53 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  26.71 
 
 
428 aa  67.4  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 
411 aa  67  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 
411 aa  67  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3612  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 
411 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.423524  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  20.89 
 
 
425 aa  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3940  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 
439 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.69 
 
 
407 aa  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3841  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 
419 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000013033  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 
410 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 
410 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4930  extracellular solute-binding protein family 1  29.38 
 
 
419 aa  65.1  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.265943  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.63 
 
 
406 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 
425 aa  64.3  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 
399 aa  64.3  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  29.04 
 
 
430 aa  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 
406 aa  63.9  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  23.46 
 
 
419 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4563  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 
439 aa  63.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 
460 aa  63.2  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1150  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 
441 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344094  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2873  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 
425 aa  62.4  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.08 
 
 
403 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1617  extracellular solute-binding protein  22.45 
 
 
460 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 
410 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 
413 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 
415 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 
397 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 
395 aa  60.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 
426 aa  60.1  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 
406 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  21.94 
 
 
430 aa  59.7  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1865  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 
454 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 
416 aa  59.7  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 
414 aa  59.7  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  21.67 
 
 
430 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  22.87 
 
 
437 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 
390 aa  58.9  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  23.62 
 
 
446 aa  58.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 
417 aa  58.2  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 
417 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 
448 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1276  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 
417 aa  57.4  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000485827  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  21.12 
 
 
408 aa  57.4  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0968  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
411 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155665  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3883  maltose/maltodextrin ABC transporter periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  26.67 
 
 
411 aa  57  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.265603 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 
425 aa  57  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2714  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 
419 aa  57  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182746  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0914  maltose/maltodextrin ABC transporter, periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  26.67 
 
 
411 aa  57  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.459005  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1500  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 
393 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  23.45 
 
 
440 aa  56.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  22.98 
 
 
410 aa  56.2  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0632  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 
434 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.708501  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 
386 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 
439 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  24.21 
 
 
439 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 
428 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>