179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2982 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2982  trehalose/maltose binding protein  100 
 
 		 281 aa  579  1e-164  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0954  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 397 aa  72.4  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.233769  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  25.9 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.34 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 		 449 aa  65.9  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2977  extracellular solute-binding protein family 1  28.5 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.576527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0572  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1088  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00683834  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  21.98 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  25.25 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  32.35 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  28.08 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  29.34 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 436 aa  60.1  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.08 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  22.96 
 
 		 397 aa  59.3  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.18 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  20.69 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0080  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.5 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 447 aa  56.6  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  21.15 
 
 		 437 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 411 aa  55.8  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 424 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  23.62 
 
 		 425 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  22.77 
 
 		 433 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  20.09 
 
 		 410 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.28 
 
 		 418 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.04 
 
 		 496 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  22.41 
 
 		 439 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 464 aa  54.3  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 		 419 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  21.85 
 
 		 450 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.27 
 
 		 426 aa  54.7  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 439 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 439 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 427 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 455 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 400 aa  53.5  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 428 aa  53.5  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 412 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 456 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 		 433 aa  52.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 		 421 aa  52.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0171  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 		 468 aa  52.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  22.59 
 
 		 421 aa  52.4  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4090  twin-arginine translocation pathway signal  26.67 
 
 		 440 aa  52.4  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.25614 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 		 412 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 446 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 435 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  22.96 
 
 		 431 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3779  extracellular solute-binding protein family 1  28.39 
 
 		 430 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.292836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0832  multiple sugar transport system substrate-binding protein  25.15 
 
 		 416 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.669088  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 416 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1658  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 		 449 aa  51.2  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.521221  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  23 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  23 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 391 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 		 459 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 440 aa  50.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  26.34 
 
 		 443 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6357  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 		 410 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 444 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 441 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 441 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  31.19 
 
 		 404 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  26.53 
 
 		 408 aa  50.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0744  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 432 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0587531  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 432 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 437 aa  49.7  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  21.86 
 
 		 422 aa  49.7  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  32.38 
 
 		 425 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.99 
 
 		 430 aa  49.7  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 450 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1138  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 		 423 aa  50.1  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1527  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 412 aa  50.1  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  21.86 
 
 		 422 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  21.86 
 
 		 422 aa  49.7  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2526  extracellular solute-binding protein family 1  29.37 
 
 		 520 aa  49.7  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430481  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 419 aa  49.7  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  21.47 
 
 		 419 aa  49.3  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  22.36 
 
 		 398 aa  49.3  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 		 433 aa  48.9  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1732  extracellular solute-binding protein family 1  29.03 
 
 		 415 aa  49.3  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000368486  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 453 aa  48.9  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 423 aa  48.9  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  31.63 
 
 		 412 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  26.91 
 
 		 445 aa  48.9  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.84 
 
 		 402 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  22.6 
 
 		 419 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>