145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0640 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0640  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
375 aa  775    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
412 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
439 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
439 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 
412 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.43 
 
 
496 aa  96.7  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 
446 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 
424 aa  87.8  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.76 
 
 
452 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  24.33 
 
 
431 aa  79.7  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 
432 aa  76.3  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  22.84 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4845  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 
434 aa  75.1  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834917  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0333  maltose/mannitol ABC transporter, periplasmic maltose/mannitol-binding protein, putative  24 
 
 
442 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00410857  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1034  extracellular solute-binding protein  24 
 
 
442 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0631  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  24 
 
 
442 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2465  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  24 
 
 
442 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0872  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  24 
 
 
442 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0876  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  24 
 
 
442 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0755942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0079  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  24 
 
 
442 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2440  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 
440 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0811647  decreased coverage  0.000336324 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5926  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.27 
 
 
441 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517551  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0695  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  23.64 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1985  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0378619  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2595  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13364  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2619  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  21.88 
 
 
444 aa  72  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  25.4 
 
 
440 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2511  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 
441 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464819  normal  0.359234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2643  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 
441 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0222782  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4181  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 
435 aa  70.1  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000770865  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 
425 aa  70.1  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 
436 aa  69.7  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0702  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 
440 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.812706  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4468  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 
436 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  22.04 
 
 
411 aa  69.7  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2144  sugar-binding periplasmic signal peptide protein  22.58 
 
 
441 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000125903  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4399  extracellular solute-binding protein family 1  22.93 
 
 
455 aa  67.4  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0609802  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  22.01 
 
 
437 aa  67.4  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  22.63 
 
 
437 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 
443 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 
443 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 
443 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  22.16 
 
 
414 aa  65.1  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 
435 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3777  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 
436 aa  64.7  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.253936  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 
436 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1179  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  22.45 
 
 
423 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0916647  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  22.19 
 
 
447 aa  63.2  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  21.73 
 
 
437 aa  62.8  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0364  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.31 
 
 
438 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  24.46 
 
 
443 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  24 
 
 
441 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2090  extracellular solute-binding protein family 1  21.34 
 
 
480 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0490  extracellular solute-binding protein  21.95 
 
 
440 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000283806  hitchhiker  0.00214005 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0230  putative transporter periplasmic binding protein  23.27 
 
 
426 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0065  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.27 
 
 
426 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0354  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.27 
 
 
426 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.824168  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1739  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.27 
 
 
426 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1650  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.27 
 
 
426 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1232  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.27 
 
 
426 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0889  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 
435 aa  61.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2640  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 
436 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932575  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  22.77 
 
 
436 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 
436 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 
436 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  22.87 
 
 
435 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  24.55 
 
 
439 aa  60.1  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4812  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 
438 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  20.4 
 
 
450 aa  59.7  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1073  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.24 
 
 
399 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2555  twin-arginine translocation pathway signal  21.15 
 
 
475 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2600  extracellular solute-binding protein  21.15 
 
 
475 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2594  extracellular solute-binding protein  21.15 
 
 
475 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0396421  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0303  extracellular solute-binding protein family 1  19.83 
 
 
478 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0848  extracellular solute-binding protein family 1  23.11 
 
 
453 aa  57.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0413942  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1681  extracellular solute-binding protein  21.84 
 
 
436 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.901925  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  21.17 
 
 
455 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.32 
 
 
422 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.32 
 
 
422 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  21.82 
 
 
455 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03697  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.61 
 
 
675 aa  57.4  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  21.82 
 
 
455 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1094  extracellular solute-binding protein  19.68 
 
 
439 aa  57.4  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  0.028756 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 
422 aa  57  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27400  periplasmic mannitol-binding protein of mannitol ABC transporter  22.99 
 
 
438 aa  56.6  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3065  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  20.77 
 
 
421 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  21.14 
 
 
440 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0720  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  21.14 
 
 
440 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000241977  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0431  extracellular solute-binding protein  20.54 
 
 
435 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34420  putative binding protein component of ABC maltose/mannitol transporter  23.08 
 
 
436 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000870468  normal  0.425479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2925  putative maltose/mannitol ABC transporter binding protein subunit  22.08 
 
 
436 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.732093  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0974  extracellular solute-binding protein family 1  21.38 
 
 
435 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606433  normal  0.163223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2041  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 
436 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3415  extracellular solute-binding protein  21.37 
 
 
438 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136491  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6665  extracellular solute-binding protein  22.5 
 
 
423 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  20 
 
 
428 aa  53.5  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 
436 aa  53.5  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>