More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2297 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2297  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
422 aa  857    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2305  extracellular solute-binding protein  61.37 
 
 
459 aa  534  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 
424 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 
459 aa  87  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 
410 aa  87  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 
419 aa  85.9  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.39 
 
 
410 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 
412 aa  84  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.7 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 
417 aa  80.5  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 
410 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 
459 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.55 
 
 
438 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 
420 aa  73.2  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 
421 aa  72.8  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
436 aa  72.8  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
428 aa  72  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 
424 aa  70.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 
432 aa  70.1  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
432 aa  69.7  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 
415 aa  69.7  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 
411 aa  69.7  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  23.66 
 
 
411 aa  69.7  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 
437 aa  69.3  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0284  extracellular solute-binding protein family 1  26.61 
 
 
414 aa  69.7  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 
416 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  26.03 
 
 
437 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 
432 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5213  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.506772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  23.38 
 
 
421 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.45 
 
 
366 aa  67  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0695  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  24.51 
 
 
441 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 
420 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 
420 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5476  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 
415 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.487316 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 
421 aa  66.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  22.63 
 
 
435 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 
436 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0473  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 
420 aa  65.1  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 
437 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.44 
 
 
435 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 
414 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
410 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0108  twin-arginine translocation pathway signal  23.08 
 
 
435 aa  63.9  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.77402 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01821  solute-binding family 1 protein  22.96 
 
 
434 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  27.39 
 
 
435 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  22.96 
 
 
431 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2511  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 
441 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464819  normal  0.359234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2643  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 
441 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0222782  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 
419 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 
425 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 
419 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 
425 aa  63.9  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 
419 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 
421 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 
440 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 
426 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2619  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 
441 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 
437 aa  63.2  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1985  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 
441 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0378619  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4472  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.95 
 
 
397 aa  63.2  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2595  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 
441 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13364  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 
426 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2977  extracellular solute-binding protein family 1  29.72 
 
 
415 aa  63.2  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.576527  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 
460 aa  63.2  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 
429 aa  62.4  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 
408 aa  63.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0490  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 
440 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000283806  hitchhiker  0.00214005 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 
419 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 
437 aa  63.2  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  25.49 
 
 
436 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5926  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.28 
 
 
441 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517551  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  30.28 
 
 
417 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 
447 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 
450 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 
425 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 
445 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  28.26 
 
 
449 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2274  extracellular solute-binding protein family 1  23.73 
 
 
428 aa  61.6  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 
419 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 
414 aa  61.6  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 
411 aa  61.6  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0333  maltose/mannitol ABC transporter, periplasmic maltose/mannitol-binding protein, putative  23.53 
 
 
442 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00410857  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
414 aa  61.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1034  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 
442 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 
413 aa  60.8  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0720  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.79 
 
 
440 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000241977  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.07 
 
 
416 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0631  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  23.53 
 
 
442 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2465  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  23.53 
 
 
442 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0872  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  23.53 
 
 
442 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0876  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  23.53 
 
 
442 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0755942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0079  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  23.53 
 
 
442 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5365  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 
418 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.559287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>